Arlequin是款專業(yè)的人類遺傳學數(shù)據(jù)分析軟件。有遺傳學有興趣的用戶可以通過軟件對統(tǒng)計數(shù)據(jù)中信息的挖掘，可進行AMOVA計算、中性檢驗、錯配分布等。Arlequin集成了單倍型頻率估計、Tajima中性檢驗、Fu中性檢驗以及遺傳距離的估計等功能。這樣就能夠準確有效的對人類遺傳學數(shù)據(jù)進行挖掘。感興趣的朋友快來下載使用吧。

軟件特色

　　1.Molecular diversity(分子多態(tài)性)；

　　2.Mismatch distribution(錯配分布)；

　　3.Haplotype frequency estimation(單倍型頻率估計)；

　　4.Linkage disequilibrium(連鎖不平衡：檢測不同位點上等位基因的非隨機關(guān)聯(lián))；

　　5.Hardy-Weinberg equilibrium(哈溫—伯格平衡)；

　　6.Tajima`s neutrality test(Tajima中性檢驗)；

　　7.Fu`s neutrality test(Fu中性檢驗)；

　　8.Ewens-watterson neutrality test(Ewens-watterson中性檢驗)；

　　9.Chakraborty`s amalgamation test (Chakraborty`s 融合檢驗，檢測人群的均一性或同質(zhì)性和中性選擇等)；

　　10.Minimu Spanning Network(最小擴張樹或稱之為最小支撐樹,，基于分子差異)；

　　11.AMOVA 分子差異度分析，用以評測人群的遺傳結(jié)構(gòu)；

　　12.Pairwise genetic distances (遺傳距離的估計)；

　　13.Exact test of population differentiation (檢測隨機交配群體單倍型的非隨機分布)；

　　14.Assignment test of genotype (通過估計等位基因頻率將單個基因型分配到特定的人群中)；

軟件介紹

　　Arlequin是一款專業(yè)的人類遺傳學數(shù)據(jù)分析軟件，這款軟件主要為從事醫(yī)學、生物學研究的用戶設(shè)計，可以從遺傳學和人口統(tǒng)計學數(shù)據(jù)中中挖掘信息，例如：大量的分子序列數(shù)據(jù)和傳統(tǒng)的等基因頻率，并提供了很多的方法和統(tǒng)計學檢驗，能夠滿足用戶多種遺傳學分析方便的需求！集成了單倍型頻率估計、Tajima中性檢驗、Fu中性檢驗以及遺傳距離的估計等功能。這樣就能夠準確有效的對人類遺傳學數(shù)據(jù)進行挖掘。還在等什么，對遺傳學有興趣的用戶可以通過軟件對統(tǒng)計數(shù)據(jù)中信息的挖掘，可進行AMOVA計算、中性檢驗、錯配分布等。

更新日志：

Arlequin v3.5.2.2

　　1、新功能：

　　直接從DNA序列數(shù)據(jù)計算位點頻譜，但僅基于次要等位基因頻譜的SFS計算

　　2、錯誤更正：

　　無法打開批處理（.arb）文件

　　當（假設(shè)祖先等位基因0）在一個站點不存在時，SFS計算不良

　　由arlequin和fastsimcoal2生產(chǎn)的不同SFS（主要用于基于MAF的SFS）

　　如果文件名超過255個字符，則會出錯

　　在arlequin日志文件中沒有提到SFS計算