Arlequin是款專業(yè)的人類遺傳學(xué)數(shù)據(jù)分析軟件。有遺傳學(xué)有興趣的用戶可以通過軟件對(duì)統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)中信息的挖掘，可進(jìn)行AMOVA計(jì)算、中性檢驗(yàn)、錯(cuò)配分布等。Arlequin集成了單倍型頻率估計(jì)、Tajima中性檢驗(yàn)、Fu中性檢驗(yàn)以及遺傳距離的估計(jì)等功能。這樣就能夠準(zhǔn)確有效的對(duì)人類遺傳學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行挖掘。感興趣的朋友快來下載使用吧。

軟件特色

　　1.Molecular diversity(分子多態(tài)性)；

　　2.Mismatch distribution(錯(cuò)配分布)；

　　3.Haplotype frequency estimation(單倍型頻率估計(jì))；

　　4.Linkage disequilibrium(連鎖不平衡：檢測(cè)不同位點(diǎn)上等位基因的非隨機(jī)關(guān)聯(lián))；

　　5.Hardy-Weinberg equilibrium(哈溫—伯格平衡)；

　　6.Tajima`s neutrality test(Tajima中性檢驗(yàn))；

　　7.Fu`s neutrality test(Fu中性檢驗(yàn))；

　　8.Ewens-watterson neutrality test(Ewens-watterson中性檢驗(yàn))；

　　9.Chakraborty`s amalgamation test (Chakraborty`s 融合檢驗(yàn)，檢測(cè)人群的均一性或同質(zhì)性和中性選擇等)；

　　10.Minimu Spanning Network(最小擴(kuò)張樹或稱之為最小支撐樹,，基于分子差異)；

　　11.AMOVA 分子差異度分析，用以評(píng)測(cè)人群的遺傳結(jié)構(gòu)；

　　12.Pairwise genetic distances (遺傳距離的估計(jì))；

　　13.Exact test of population differentiation (檢測(cè)隨機(jī)交配群體單倍型的非隨機(jī)分布)；

　　14.Assignment test of genotype (通過估計(jì)等位基因頻率將單個(gè)基因型分配到特定的人群中)；

軟件介紹

　　Arlequin是一款專業(yè)的人類遺傳學(xué)數(shù)據(jù)分析軟件，這款軟件主要為從事醫(yī)學(xué)、生物學(xué)研究的用戶設(shè)計(jì)，可以從遺傳學(xué)和人口統(tǒng)計(jì)學(xué)數(shù)據(jù)中中挖掘信息，例如：大量的分子序列數(shù)據(jù)和傳統(tǒng)的等基因頻率，并提供了很多的方法和統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn)，能夠滿足用戶多種遺傳學(xué)分析方便的需求！集成了單倍型頻率估計(jì)、Tajima中性檢驗(yàn)、Fu中性檢驗(yàn)以及遺傳距離的估計(jì)等功能。這樣就能夠準(zhǔn)確有效的對(duì)人類遺傳學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行挖掘。還在等什么，對(duì)遺傳學(xué)有興趣的用戶可以通過軟件對(duì)統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)中信息的挖掘，可進(jìn)行AMOVA計(jì)算、中性檢驗(yàn)、錯(cuò)配分布等。

更新日志：

Arlequin v3.5.2.2

　　1、新功能：

　　直接從DNA序列數(shù)據(jù)計(jì)算位點(diǎn)頻譜，但僅基于次要等位基因頻譜的SFS計(jì)算

　　2、錯(cuò)誤更正：

　　無法打開批處理（.arb）文件

　　當(dāng)（假設(shè)祖先等位基因0）在一個(gè)站點(diǎn)不存在時(shí)，SFS計(jì)算不良

　　由arlequin和fastsimcoal2生產(chǎn)的不同SFS（主要用于基于MAF的SFS）

　　如果文件名超過255個(gè)字符，則會(huì)出錯(cuò)

　　在arlequin日志文件中沒有提到SFS計(jì)算