Primer Premier是一款由Premier公司推出的專業(yè)的引物設(shè)軟件，用來幫助研究人員設(shè)計最適合引物的應(yīng)用軟件，這是一款經(jīng)典的版本，Primer Premier支持win7 操作系統(tǒng)，具有PCR或測序引物以及雜交探針設(shè)計功能，本平臺提供Primer Premier 64位免費版，需要的朋友可以下載！

軟件特色

1、Primer Premier 64位主要界面是分為序列編輯窗口(Genetank)，引物設(shè)計窗口(Primer Design)，酶切分析窗口(Restriction Sites)和紋基分析窗口(Motif)。
2、該軟件就是用來進行引物設(shè)計的。
3、可以簡單地通過手動拖動鼠標以擴增出相應(yīng)片段所需的引物。
4、在手動的任何時候，下面顯示各種參數(shù)的改變和可能的二聚體、異 二聚體、發(fā)夾結(jié)構(gòu)等。也可以給定條件，讓軟件自動搜索引物，并將引物分析結(jié)果顯示出來。
5、而且進行這些操作非常簡單。

新功能

1、新改進的搜索算法

新改進的搜索算法。

自動避免同源性和模板結(jié)構(gòu)。

序列視圖，用于可視化序列上的引物。

新改進的圖形用戶界面。

2、自動序列檢索

使用登錄/GI 編號和檢測 ID 從 GenBank 和 dbSNP 直接快速檢索序列批次到程序中。使用多重檢索工具，可以從本地驅(qū)動器加載序列。

3、自動同源性和模板結(jié)構(gòu)規(guī)避

引物特異性可以通過執(zhí)行BLAST搜索和從程序中搜索模板結(jié)構(gòu)來實現(xiàn)。在設(shè)計引物時，會使用這兩種檢索的結(jié)果。在引物設(shè)計過程中，會自動避開表現(xiàn)出顯著交叉同源性和模板結(jié)構(gòu)的區(qū)域。

4、評估預(yù)先設(shè)計的引物

Primer Premier對預(yù)先設(shè)計的引物進行分析和評估，并對其進行排序，以便您判斷引物與所需目標值的距離。如果您正在使用已發(fā)布或預(yù)先設(shè)計的經(jīng)過充分驗證的引物，此功能特別有用。還可以評估多達 5 個錯配的引物。

對于特定的底漆，Primer Premier甚至可以設(shè)計出兼容的套裝。例如，對于預(yù)先設(shè)計或發(fā)布的正向引物，Primer Premier可以找到符合所有設(shè)計標準的兼容反向引物。

您可以評估正向/反向引物或引物對，甚至無需輸入模板序列。Primer Premier顯示所分析寡核苷酸的所有特性，并以HTML或csv文件格式導(dǎo)出。對引物進行排序，使您能夠判斷它們與目標值的接近程度。

5、手動引物搜索

Primer Premier 可在用戶手中完全控制底漆設(shè)計。使用手動引物搜索選項，用戶可以單擊模板序列上的任何核苷酸，以在他們選擇的位置獲得引物。Primer Premier設(shè)計了一種引物，其3'端位于該核苷酸上，并立即分析其性質(zhì)。引物的長度也可以根據(jù)用戶的方便增加/減少。對于誘變和克隆，此功能有助于在其他受限區(qū)域內(nèi)獲得最佳設(shè)計。Primer Premier能夠沿著DNA序列“滑動”引物序列，實時顯示其特性，使用戶能夠可視化定位寡核苷酸的最佳位置。

6、編輯模板序列

可以編輯模板序列?？梢允褂脴藴实募羟?復(fù)制/粘貼功能修改基底，以將感興趣的位置歸零。不需要的序列區(qū)域可以通過選擇它們并單擊“刪除”來刪除。該程序還允許用戶為序列添加注釋或注釋以供將來參考。

7、序列視圖

所選序列可以以每塊 3 或 10 個堿基、單鏈或雙鏈進行查看。設(shè)計引物有標記，意義引物為藍色，反義引物為紅色。選定的 SNP 標記為粉紅色。同源區(qū)域以黃色突出顯示，參與模板結(jié)構(gòu)的堿基帶有下劃線。您可以將“序列視圖”與引物設(shè)計結(jié)果一起導(dǎo)出為csv或HTML格式。

8、生成報告

您可以為實驗室筆記本和與同事共享信息而設(shè)計的檢測創(chuàng)建演示質(zhì)量報告。該報告可視化了引物在序列上的位置，包括替代引物的列表，顯示引物、擴增子和序列屬性以及引物設(shè)計程序使用的設(shè)計參數(shù)。

9、本地和桌面 BLAST 選項

您可以使用“本地”和“桌面 BLAST”選項針對本地自定義數(shù)據(jù)庫對序列進行 BLAST。在計算機上創(chuàng)建文本或 FASTA 格式的序列數(shù)據(jù)庫，然后從 Primer Premier 中打開查詢序列。然后將結(jié)果用于引物設(shè)計。如果您不想在 Internet 上提交數(shù)據(jù)，或者您正在處理未發(fā)布的信息，則此支持特別有用。

10、計算器

內(nèi)置計算器可計算 GC%，顯示堿基計數(shù)，并使您能夠獲得互補和反向互補鏈。

11、數(shù)據(jù)和數(shù)據(jù)庫管理

可以創(chuàng)建多個項目。通過為每個實驗創(chuàng)建單獨的項目，可以輕松管理多個實驗的數(shù)據(jù)。維護序列信息和搜索結(jié)果的本地數(shù)據(jù)庫。

安裝說明

安裝Primer Premier 6

（比如你放到D盤）解壓crack，看里面有一個crack的txt文件，打開，按照上面的說明來操作：
1.把crack這整個壓縮包剪切到 這個目錄下：
D:\Program Files\Primer Premier 6.0\http\Dwww.premierbiosoft.com\P80\DMIUpdater\DMPP\DM600
2.然后從電腦的“開始”中找到運行，或直接按“windows+R”，輸入cmd，打開dos系統(tǒng)
3.輸入d: 回車
4.然后輸入（鼠標右鍵粘貼）
cd D:\Program Files\Primer Premier 6.0\http\Dwww.premierbiosoft.com\P80\DMIUpdater\DMPP\DM600 回車
5.再輸入“java -jar patcher.jar”回車