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詳情介紹
UCSF Chimera Mac版是一款I(lǐng)OS系統(tǒng)上運(yùn)行的專門用于分子結(jié)構(gòu)模擬的工具,軟件支持分子結(jié)構(gòu)和相關(guān)數(shù)據(jù)的交互可視化分析,分析數(shù)據(jù)包括密度圖,超分子組合,順序排列,對(duì)接結(jié)果等,可以生成圖像和動(dòng)畫,需要的朋友可以前來(lái)本站下載。
windows版:UCSF Chimera(分子結(jié)構(gòu)可視化軟件)V1.13.1 英文免費(fèi)安裝版
Mac版:UCSF Chimera(分子結(jié)構(gòu)可視化軟件)for Mac V1.13.1 蘋果電腦版
linux版:UCSF Chimera(分子結(jié)構(gòu)可視化軟件)V1.13.1 linux最新免費(fèi)版
軟件特色
1、提供了一組有用的特性和清晰的界面。
2、在第一次啟動(dòng)應(yīng)用程序時(shí),你會(huì)遇到一個(gè)幾乎太簡(jiǎn)單的主窗口,它只不過(guò)是一個(gè)可視化面板和一個(gè)緊湊的菜單欄,不像通常使用廣泛工具欄的其他分子分析工具。
3、因此,UCSF嵌合體犧牲了一點(diǎn)實(shí)用性,以便為分子分析提供一種無(wú)干擾的環(huán)境。它還有一個(gè)龐大的文檔部分,你應(yīng)該花一些時(shí)間來(lái)閱讀,因?yàn)樗梢詭椭憧s短學(xué)習(xí)時(shí)間的一半。
4、附帶了一套廣泛的可視化和分析工具
5當(dāng)談到特性時(shí),公用事業(yè)提供的東西比你想象的要多。首先,你應(yīng)該知道它可以產(chǎn)生高質(zhì)量的圖像和動(dòng)畫。它還附帶了一個(gè)序列查看器,它實(shí)際上使您可以查找、查看和編輯序列比對(duì)。
6、沒(méi)有過(guò)分復(fù)雜的事情,應(yīng)該提到的工具來(lái)支持交互式陰影,變形,Ramachandran圖和爆破蛋白。
7、分子分析的有力工具
8、您還應(yīng)該知道UCSF Cimeta使您能夠改變背景,即您可以將圖形窗口更改為單個(gè)顏色、多個(gè)顏色的垂直漸變,甚至從計(jì)算機(jī)加載圖像。
9、該實(shí)用工具帶有一個(gè)流線型的界面,一個(gè)龐大的文檔,教程和例子,可以幫助你馬上開(kāi)始。底線,UCSF嵌合體是一個(gè)強(qiáng)大的應(yīng)用分子分析,包裝許多有用的特點(diǎn),而不感到害怕。
功能介紹
1、強(qiáng)大的軸、平面和質(zhì)心功能,軸可以表示為圓柱體,平面表示為圓盤,質(zhì)心表示為球體,這些都可以用于距離和角度測(cè)量。
2、體積數(shù)據(jù):可以顯示三維電子和光學(xué)顯微鏡數(shù)據(jù)、x射線密度圖、靜電勢(shì)和其他體積數(shù)據(jù)。
3、b因子著色:可以對(duì)結(jié)構(gòu)著色以顯示屬性值
4、篩選分子對(duì)接
5、通過(guò)保護(hù)著色
6、卷平面顯示
7、旋轉(zhuǎn)異構(gòu)體
使用說(shuō)明
通過(guò)點(diǎn)擊或雙擊嵌合體圖標(biāo)(取決于它的位置)來(lái)啟動(dòng)嵌合體。通常,這個(gè)圖標(biāo)將出現(xiàn)在桌面上。Cimela可執(zhí)行文件也可以從其安裝位置運(yùn)行。
將出現(xiàn)一個(gè)飛濺屏幕,在幾秒鐘內(nèi)由包含圖形顯示或最近使用的文件的快速訪問(wèn)列表的主嵌合體窗口替換(這并不重要,因?yàn)榇蜷_(kāi)一個(gè)結(jié)構(gòu)將自動(dòng)將顯示器切換到圖形窗口)。如果你喜歡,通過(guò)點(diǎn)擊并拖動(dòng)右下角來(lái)放大窗口。窗口也可以通過(guò)點(diǎn)擊它的頂部欄和拖動(dòng)來(lái)移動(dòng)。
打開(kāi)結(jié)構(gòu)
現(xiàn)在打開(kāi)一個(gè)結(jié)構(gòu)。從菜單中選擇文件ID ID獲取,并將1ZIK作為結(jié)構(gòu)的ID從PDB中取出。該結(jié)構(gòu)將出現(xiàn)在圖形窗口中,它是由兩個(gè)肽形成的亮氨酸拉鏈。
默認(rèn)的初始顯示是色帶。也顯示原子:
這顯示了結(jié)構(gòu)中的所有原子和鍵,除了肽鏈中的那些被絲帶顯示抑制。下面討論如何顯示用于顯示、著色等結(jié)構(gòu)的特定部分。最初,雜原子(碳以外的原子)由元素組成:氧原子、氮原子、藍(lán)色等。碳保持模型顏色,在這種情況下是棕褐色。
隱藏緞帶,露出骨架原子,然后再次展示緞帶
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