Gene Runner是一款十分不錯(cuò)的 基因序列分析軟件。這款軟件為生物學(xué)家提供了多種分析方式，確保分析結(jié)果百分百準(zhǔn)確，為生物研究做出巨大的貢獻(xiàn)。本站提供的是該軟件的英文安裝版本，需要的朋友快來(lái)本站下載使用吧！

軟件介紹

生物基因分析Gene Runner是一個(gè)專(zhuān)業(yè)的應(yīng)用，為遺傳學(xué)家和生物學(xué)家提供了可靠的工具，可以幫助他們進(jìn)行基因分析提供方便。

該應(yīng)用程序需要包含遺傳信息序列格式的文件，然后可以使用“ORF”(開(kāi)放閱讀框)按鈕，使用戶(hù)能夠設(shè)置首選核苷酸或氨基酸大小，以及選擇“轉(zhuǎn)換表”分析一起工作。開(kāi)的ORF項(xiàng)目后，用戶(hù)可進(jìn)行各種注釋為每個(gè)條目。

在'序列和雜交分析“功能允許用戶(hù)顯示所選擇的DNA部分的引物的特性，或放棄某些類(lèi)型的引物。

基因轉(zhuǎn)輪保存在表格上氨基酸的信息和該數(shù)據(jù)也可與“蛋白質(zhì)分析”函數(shù)中，“抑制”和“轉(zhuǎn)換表'使用。這是必需的作為基因轉(zhuǎn)輪將發(fā)送一個(gè)錯(cuò)誤消息，如果使用的氨基酸未在所述表格中定義的。此外，關(guān)于這些元素的所有信息是可編輯的，這樣用戶(hù)就可以充分地調(diào)整自己的價(jià)值觀。

軟件功能

1、查找：在此框中輸入查詢(xún)序列。查詢(xún)序列可能包含IUPAC通配符。堿基或氨基酸總數(shù)顯示在查詢(xún)框右側(cè)的框中。也可以使用shift+ins或ctrl+v鍵從剪貼板粘貼查詢(xún)序列(打開(kāi)對(duì)話(huà)框窗口時(shí)，不能使用菜單中的編輯粘貼)。這個(gè)發(fā)現(xiàn)只接受一個(gè)字母的氨基酸代碼。在一個(gè)或三個(gè)字母的代碼顯示中可以找到合適的氨基酸。如果find以前用于當(dāng)前序列，請(qǐng)鍵入以前搜索的文本。每個(gè)序列都有自己的查找內(nèi)存。

2、主題：當(dāng)搜索設(shè)置為蛋白質(zhì)時(shí)，單擊向下箭頭顯示Prosite主題的下拉列表。有關(guān)prosite及其序列約定的說(shuō)明，請(qǐng)參見(jiàn)下文。當(dāng)設(shè)置為核酸時(shí)，將顯示核酸基序列表。選擇所需的主題。然后，Motif會(huì)自動(dòng)輸入find:框中。此特征允許識(shí)別TATA盒、AP1結(jié)合位點(diǎn)、N-糖基化位點(diǎn)等。

3、類(lèi)型：確定執(zhí)行的搜索類(lèi)型：標(biāo)準(zhǔn)、主題或不匹配。

4、標(biāo)準(zhǔn)是對(duì)在“查找：”框中輸入的查詢(xún)序列的正常搜索。用于簡(jiǎn)單搜索或核酸搜索，所有堿基/氨基酸必須完全匹配。

5、motif是在motif框中搜索查詢(xún)序列，或使用prosite約定在find:框中輸入的序列，請(qǐng)參見(jiàn)下文。蛋白質(zhì)和核酸的基序可以以相同的慣例輸入。注意：此搜索比標(biāo)準(zhǔn)搜索慢。

6、mismatch<=將搜索設(shè)置為不匹配，并設(shè)置查詢(xún)序列中不匹配堿基/氨基酸的最大數(shù)目。默認(rèn)設(shè)置為查詢(xún)序列長(zhǎng)度/5。stk>=設(shè)置不匹配搜索中相鄰堿基/氨基酸(一個(gè)堆棧)的最小數(shù)目。默認(rèn)設(shè)置為查詢(xún)序列長(zhǎng)度/2。與不匹配參數(shù)一起使用，以微調(diào)搜索。例如，如果將不匹配設(shè)置為4，并且在18個(gè)低聚物上將STK設(shè)置為6，則所找到的序列必須至少包含6個(gè)連續(xù)的完全匹配堿基，并且總共不超過(guò)4個(gè)不匹配堿基。當(dāng)“全部顯示”命令處于活動(dòng)狀態(tài)時(shí)，所有不匹配的序列都將突出顯示。用于檢查雜交探針、測(cè)序引物等，以確定假啟動(dòng)部位。

7、find僅搜索活動(dòng)序列中第一個(gè)出現(xiàn)的查詢(xún)序列。光標(biāo)位于查詢(xún)序列的5'堿基(或蛋白質(zhì)中的氨基末端)，查詢(xún)序列突出顯示。搜索從光標(biāo)位置開(kāi)始到序列結(jié)束。即使查詢(xún)序列擴(kuò)展到循環(huán)序列開(kāi)始和結(jié)束之間的“joint”上，也會(huì)找到該查詢(xún)序列。狀態(tài)欄顯示找到序列的第一個(gè)和最后一個(gè)堿基或氨基酸的位置。要再次搜索查詢(xún)序列的另一個(gè)匹配項(xiàng)，請(qǐng)?jiān)?ldquo;編輯”菜單下選擇“再次查找”。快捷鍵是F6。“再次查找”按鈕位于工具欄中“查找”按鈕旁邊。

軟件特點(diǎn)

1、格式化多行復(fù)制

2、EZ Clone - 解決復(fù)雜克隆問(wèn)題的簡(jiǎn)單方法

3、查看ABI文件 - 單個(gè)序列或多個(gè)ABI文件的對(duì)齊

4、動(dòng)態(tài)搜索 - 在編輯序列時(shí)自動(dòng)搜索和突出顯示

Gene Runner安裝教程

1、首先在腳本之家網(wǎng)站下載Gene Runner v6.5.51安裝包，雙擊打開(kāi)

2、選擇安裝位置

3、正在安裝，請(qǐng)稍等

4、完成安裝，打開(kāi)軟件

5、進(jìn)入軟件主界面