chromas(基因測序峰圖查看軟件) v1.6.2 英文綠色免費版
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金排生物畫板 v8.0 免費安裝版
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云譯通生物醫(yī)藥版 v2.4.0.2 免費安裝版
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生物鐘計算 v1.0 綠色免費版
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Cytoscape(生物信息分析軟件) V3.6.1 免費安裝版
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詳情介紹
軟件介紹
生物基因分析Gene Runner是一個專業(yè)的應用,為遺傳學家和生物學家提供了可靠的工具,可以幫助他們進行基因分析提供方便。
該應用程序需要包含遺傳信息序列格式的文件,然后可以使用“ORF”(開放閱讀框)按鈕,使用戶能夠設置首選核苷酸或氨基酸大小,以及選擇“轉換表”分析一起工作。開的ORF項目后,用戶可進行各種注釋為每個條目。
在'序列和雜交分析“功能允許用戶顯示所選擇的DNA部分的引物的特性,或放棄某些類型的引物。
基因轉輪保存在表格上氨基酸的信息和該數(shù)據(jù)也可與“蛋白質分析”函數(shù)中,“抑制”和“轉換表'使用。這是必需的作為基因轉輪將發(fā)送一個錯誤消息,如果使用的氨基酸未在所述表格中定義的。此外,關于這些元素的所有信息是可編輯的,這樣用戶就可以充分地調整自己的價值觀。
軟件功能
1、查找:在此框中輸入查詢序列。查詢序列可能包含IUPAC通配符。堿基或氨基酸總數(shù)顯示在查詢框右側的框中。也可以使用shift+ins或ctrl+v鍵從剪貼板粘貼查詢序列(打開對話框窗口時,不能使用菜單中的編輯粘貼)。這個發(fā)現(xiàn)只接受一個字母的氨基酸代碼。在一個或三個字母的代碼顯示中可以找到合適的氨基酸。如果find以前用于當前序列,請鍵入以前搜索的文本。每個序列都有自己的查找內存。
2、主題:當搜索設置為蛋白質時,單擊向下箭頭顯示Prosite主題的下拉列表。有關prosite及其序列約定的說明,請參見下文。當設置為核酸時,將顯示核酸基序列表。選擇所需的主題。然后,Motif會自動輸入find:框中。此特征允許識別TATA盒、AP1結合位點、N-糖基化位點等。
3、類型:確定執(zhí)行的搜索類型:標準、主題或不匹配。
4、標準是對在“查找:”框中輸入的查詢序列的正常搜索。用于簡單搜索或核酸搜索,所有堿基/氨基酸必須完全匹配。
5、motif是在motif框中搜索查詢序列,或使用prosite約定在find:框中輸入的序列,請參見下文。蛋白質和核酸的基序可以以相同的慣例輸入。注意:此搜索比標準搜索慢。
6、mismatch<=將搜索設置為不匹配,并設置查詢序列中不匹配堿基/氨基酸的最大數(shù)目。默認設置為查詢序列長度/5。stk>=設置不匹配搜索中相鄰堿基/氨基酸(一個堆棧)的最小數(shù)目。默認設置為查詢序列長度/2。與不匹配參數(shù)一起使用,以微調搜索。例如,如果將不匹配設置為4,并且在18個低聚物上將STK設置為6,則所找到的序列必須至少包含6個連續(xù)的完全匹配堿基,并且總共不超過4個不匹配堿基。當“全部顯示”命令處于活動狀態(tài)時,所有不匹配的序列都將突出顯示。用于檢查雜交探針、測序引物等,以確定假啟動部位。
7、find僅搜索活動序列中第一個出現(xiàn)的查詢序列。光標位于查詢序列的5'堿基(或蛋白質中的氨基末端),查詢序列突出顯示。搜索從光標位置開始到序列結束。即使查詢序列擴展到循環(huán)序列開始和結束之間的“joint”上,也會找到該查詢序列。狀態(tài)欄顯示找到序列的第一個和最后一個堿基或氨基酸的位置。要再次搜索查詢序列的另一個匹配項,請在“編輯”菜單下選擇“再次查找”??旖萱I是F6。“再次查找”按鈕位于工具欄中“查找”按鈕旁邊。
軟件特點
1、格式化多行復制
2、EZ Clone - 解決復雜克隆問題的簡單方法
3、查看ABI文件 - 單個序列或多個ABI文件的對齊
4、動態(tài)搜索 - 在編輯序列時自動搜索和突出顯示
Gene Runner安裝教程
1、首先在腳本之家網(wǎng)站下載Gene Runner v6.5.51安裝包,雙擊打開
2、選擇安裝位置
3、正在安裝,請稍等
4、完成安裝,打開軟件
5、進入軟件主界面
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