Schrodinger PyMOL是一款功能強(qiáng)大的分子查看器和渲染器。 它可用于準(zhǔn)備出版質(zhì)量的圖形、與同事共享交互式結(jié)果或生成預(yù)渲染動畫。 如今，全世界成千上萬的科學(xué)家經(jīng)常依賴 PyMOL 來完成此類任務(wù)。

PyMOL破解版主要是圖形、電影和演示文稿生成工具。 然而，它也可以用于各種常規(guī)和專業(yè)任務(wù)，例如靜電表面電位和分子動力學(xué)軌跡的可視化。

在圖形制作方面，PyMOL 是 Molscript、BobScript、PovScript 和 Raster3D 的替代品。 PyMOL 相對于這些包的主要優(yōu)勢是能夠使用圖形用戶界面代替（或除此之外）命令行腳本。

關(guān)于電影生成，PyMOL 可以創(chuàng)建和輸出 3D 分子電影，其方式與這些其他工具對一般 3D 動畫 Maya、Blender、Cinema4D 和 3ds Max 所做的大致相同。 PyMOL 還可用于生成幾何輸入，以與這些通用動畫工具一起使用。

關(guān)于演示文稿，PyMOL 的工作方式類似于動畫 3D 分子 PowerPoint，因?yàn)?PyMOL 會話（類似于 PowerPoint PPT 文件）可以使用一系列場景（類似于 PowerPoint 幻燈片）構(gòu)建，這些場景從一個平滑地流動到另一個以傳達(dá)結(jié)果或告訴故事。

安裝激活教程

1、在本站下載并解壓，如圖所示

2、安裝程序，勾選agree

3、選擇all users選項(xiàng)

4、安裝完成，將破解的文件復(fù)制到安裝目錄中，替換

5、運(yùn)行程序，點(diǎn)擊browse選擇剛才復(fù)制過去的lic許可證文件

新功能

2.5.4新功能

1、獨(dú)家激勵 PyMOL 功能

所有 PyMOL 操作的多級撤消/重做

MAE 導(dǎo)入：更多功能區(qū)樣式和標(biāo)簽改進(jìn)

MAE 導(dǎo)入對話框：離散狀態(tài)支持

構(gòu)建器：來自PDB的核苷酸現(xiàn)在可以擴(kuò)展

APBS 插件：PDB2PQR 3 兼容性

STL 導(dǎo)出：導(dǎo)出時的平均法線

“sphere_mode”的 10/11 縮放

生成器：“清除殘留物”按鈕添加

加載 collada 作為 CGO

2、文件導(dǎo)入/導(dǎo)出

DX 二進(jìn)制映射導(dǎo)入支持 （*dxbin）

PDB/MMTF 導(dǎo)出：現(xiàn)在添加了對稱信息

改進(jìn)的 FASTA 導(dǎo)入

支持地圖.gz和 mrc.gz 擴(kuò)展

3、建筑商和面板

生成器：改進(jìn)的保險絲命令（不允許超價鍵，替換一價原子而不是附著在它們上）

面板：可自定義的鍵盤快捷菜單

面板：屬性檢查器現(xiàn)在支持使用“刪除”鍵取消設(shè)置設(shè)置

4、圖形與可視化

光線內(nèi)部顏色現(xiàn)在與“設(shè)置ray_interior_color，原子”匹配基元 120

等值網(wǎng)格透明度支持

“sphere_mode”刪除了 5（9 作為替換）

彎曲的卡通圓柱形螺旋“cartoon_cylindrical_helices=1”（前一個=2）。#131

通過設(shè)置“isosurface_algorithm， （0， 1）”的行進(jìn)立方體生成等值面（0 需要 VTKm）

5、中國人民銀行處理

在重新粘合、平滑和intra_fit中支持的周期性邊界條件

6、接口更改

刪除了對 Python 2 的支持

添加了 PBC 參數(shù)以重新綁定、平滑和intra_fit

png（無） 返回字節(jié)

scene_order（） 允許“名稱”列表

添加了pbc_wrap（） 和pbc_unwrap

matrix_reset（） 支持所有狀態(tài)的“state=0”

editing_ring（） 已添加

取消設(shè)置現(xiàn)在恢復(fù)全局設(shè)置的默認(rèn)值

load_traj現(xiàn)在默認(rèn)使用 state=1

get_area命令和點(diǎn)表示形式：排除“標(biāo)志忽略”原子

功能特色

1、圖形質(zhì)量

內(nèi)置的光線追蹤器可為您提供任何場景的陰影和深度。您也可以在外部渲染。

2、電影

創(chuàng)建電影就像加載多個PDB文件并點(diǎn)擊播放一樣簡單。

3、輸出選項(xiàng)

圖像可以直接復(fù)制和粘貼到PowerPoint和Keynote中。靜態(tài)圖像和渲染序列可以PNG格式輸出，也可以輸出為QuickTime電影（在Mac OS X上）。

4、原子選擇

任意邏輯表達(dá)式有助于集中可視化和編輯。

5、表面再現(xiàn)

與Grasp一樣好，甚至更好，并且也支持網(wǎng)格表面。

6、卡通再現(xiàn)

PyMOL的卡通幾乎與Molscript一樣漂亮，但更容易創(chuàng)建和渲染。

7、命令行和GUI控制

復(fù)雜的“現(xiàn)實(shí)世界”應(yīng)用程序通常需要兩者。

8、Molecular Splits/Joins

結(jié)構(gòu)可以在運(yùn)行中被切片、突變和重組，并寫入標(biāo)準(zhǔn)文件（即PDB、MOL/SDF）。

9、腳本

控制PyMOL的最佳方法之一是通過可重用的腳本，這些腳本可以用命令語言或Python編寫。

10、構(gòu)象編輯

點(diǎn)擊和拖動界面允許您自然地編輯構(gòu)象。雕刻允許分子適應(yīng)您的變化。

11、可擴(kuò)展性

PyMOL Python API提供了一種可靠的擴(kuò)展和接口方式。

12、跨平臺代碼

單一代碼庫支持Unix、Macintosh和Windows，使用OpenGL和Python以及一小組開源外部依賴項(xiàng)。