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詳情介紹
snapgene中文版是一款非常優(yōu)秀且界面簡潔的DNA序列分析軟件??梢詭椭脩舴奖愕姆治雒盖形稽c(diǎn)、標(biāo)簽、啟動子、終止子和復(fù)制子等質(zhì)粒原件,生成詳細(xì)的DNA序列文件。小編還提供了snapgene使用教程,需要的朋友快快來下載snapgene中文版最新版!
SnapGene是一款計(jì)劃和模擬DNA操縱的軟件工具,已被創(chuàng)建為數(shù)字化文檔DNA構(gòu)建的替代方法,可以輕松地在網(wǎng)絡(luò)上共享結(jié)果。它可用于查看和注釋DNA序列。可視化和記錄您的分子生物學(xué)程序的最快速和最簡單的方法。流線型界面支持一系列克隆和PCR操作。
SnapGene不是普通用戶而研發(fā)的,因?yàn)樗哪康氖强茖W(xué)的,但如果您熟悉術(shù)語和DNA序列,那么應(yīng)該不會太長,直到您發(fā)現(xiàn)應(yīng)用程序中包含的可能性。加載DNA文件(程序中有一些樣品)后,您可以開始分析遺傳序列。它允許通過顯示開放閱讀框(ORF)找到基因,用戶可以添加,編輯,刪除或重復(fù)特征或引物。
軟件特點(diǎn)
1.輕松計(jì)劃和模擬DNA操作。
2.可視化的ORF閱讀框,和引物結(jié)合位點(diǎn)。
3.自動記錄在克隆項(xiàng)目的步驟。
4.與其他研究人員共享注明的序列文件。
破解安裝步驟:
安裝“snapgene_2.3.2_win.exe”后運(yùn)行**補(bǔ)丁“SnapGene_2.3.2_Windows_Crack.exe”,在“username”處填入想要顯示的注冊名,點(diǎn)擊“patch”并定位到程序文件夾即可。
安裝教程
1、雙擊“snapgene_1.1.3_win.exe”開始安裝
2、點(diǎn)擊next設(shè)置開始菜單文件夾名稱
3、設(shè)置軟件安裝目錄,默認(rèn)為“C:\Program Files (x86)\SnapGene”
4、點(diǎn)擊install安裝即可
使用教程
一、 SnapGene中的幾個View介紹
View1:Map
1. 打開一個質(zhì)粒圖譜文件,在Topology option處選擇circular。得如下界面:
顯示質(zhì)粒圖譜的酶切位點(diǎn)。右側(cè)箭頭可顯示不同廠家出售的酶。
顯示質(zhì)粒圖譜的開放閱讀框及轉(zhuǎn)錄方向。點(diǎn)擊其顯示的箭頭可顯示該ORF的片段大小、GC%值等一些信息。
顯示片段名稱。
△給非編碼序列命名:如多克隆位點(diǎn)。先找到質(zhì)粒圖譜中的多克隆位點(diǎn)的第一個酶切位點(diǎn)和最后一個酶切位點(diǎn)。點(diǎn)擊左側(cè)sequence ,找到兩個酶切位點(diǎn)之間的序列。
View2:Sequence
點(diǎn)擊Sequence,得到如下界面:
顯示編碼的氨基酸序列,有縮寫和全寫兩種。
View3:
Enzymes
點(diǎn)擊Enzymes,得到如下界面:
View4:Features
點(diǎn)擊Features,得到如下界面:
顯示各個已命名片段的一些特點(diǎn)。
二、 對片段進(jìn)行注釋
1.給編碼序列命名:
點(diǎn)擊其中一個箭頭,按Feature→Add Translated Feature,彈出以下窗口:
Feature:給該片段命名。
Type:選擇該片段的類型,右側(cè)箭頭代表閱讀方向。
Color:選擇顏色。
2. 給非編碼序列命名:如多克隆位點(diǎn)。先找到質(zhì)粒圖譜中的多克隆位點(diǎn)的第一個酶切位點(diǎn)和最后一個酶切位點(diǎn)。點(diǎn)擊左側(cè)sequence,找到兩個酶切位點(diǎn)之間的序列。
3. 給質(zhì)粒圖譜增加引物序列:按Edit→Find,輸入引物序列,找到質(zhì)粒序列對應(yīng)位置,點(diǎn)擊Primers→Addprimer,彈出該界面:
按上下游引物選擇TopStrand還是BottomStrand,在Primer處可給該引物命名,隨后即可顯示該引物在圖譜Map中的位置。
三、 創(chuàng)建新DNA文件
1. 打開SnapGene,點(diǎn)擊New DNA File,彈出以下窗口:
在Create the following sequence窗口下輸入DNA序列,并對該文件命名,點(diǎn)擊OK?;蚴屈c(diǎn)擊Import from Genebank,輸入NCBI中某序列的access number,點(diǎn)擊OK。
2.此時彈出如下窗口:
3.對該序列進(jìn)行注釋:點(diǎn)擊Features→Add Feature,對該序列進(jìn)行命名注釋。
△創(chuàng)建質(zhì)粒圖譜文件方法相同。
四、處理序列翻譯信息
1.創(chuàng)建一個DNA序列文件,點(diǎn)擊
2.顯示如下箭頭:
黃色箭頭代表的是上面一條鏈編碼序列,綠色箭頭代表的是下面一條鏈編碼序列。
3.點(diǎn)擊Sequence,點(diǎn)擊右側(cè)箭頭,選擇All 6 Frames,可得到編碼序列的所有情況,其中
代表的是終止密碼子。
4.添加內(nèi)含子:根據(jù)內(nèi)含子的位置,點(diǎn)擊Edit→Select Range,輸入內(nèi)含子堿基位置。點(diǎn)擊Features→Delete Feature Segment,得到如下圖:
紫色粗帶為外顯子,虛線為內(nèi)含子部分。
五、引物、PCR和突變繪制
1.PCR引物繪制:在多克隆位點(diǎn)處找到合適的兩個酶切位點(diǎn)。如BamHI和XbaI,在目的基因兩側(cè)截取15-30bp序列,點(diǎn)擊Primers→Addprimers,選擇top strand或bottom strand,如圖:
給該引物命名,然后點(diǎn)擊Insertion,在該引物上添加之前選擇好的酶切位點(diǎn)序列,如圖選擇了BamHI,點(diǎn)解Insert:
然后在該序列5端上添加數(shù)個堿基作為保護(hù)堿基。點(diǎn)擊完成。
△下游引物設(shè)計(jì)相同,不再贅述。
2.突變引物繪制:在目的基因上截取一小段包含要突變位點(diǎn)的序列,點(diǎn)擊Primers→Add primers,為該引物命名,在5’序列突變位點(diǎn)的三個堿基畫黑,如圖:
點(diǎn)擊Insertions,選擇突變成的氨基酸,點(diǎn)擊Insert。即可獲得該突變引物,點(diǎn)擊Reverse Complement,可獲得反向引物。
六、模擬標(biāo)準(zhǔn)限制性克隆
1.打開被插入片段的質(zhì)粒圖譜,選擇合適的兩個酶切位點(diǎn),如HindIII和ApaI,如圖:
點(diǎn)擊Actions→Insert Fragment,點(diǎn)擊HindIII+鍵盤Shift鍵+Apa,點(diǎn)擊Insert,在source of fragment處選擇插入的目的片段來源。點(diǎn)擊上述同樣的酶,給該重組質(zhì)粒命名,點(diǎn)擊clone。
七、 模擬融合克隆
1. 打開一個需要插入片段質(zhì)粒圖譜,點(diǎn)擊Actions→Insert One Fragments,彈出以下窗口:
2. 點(diǎn)擊sequence,找到想要發(fā)生替換的位點(diǎn)。
3. 點(diǎn)擊Fragment,在Source of Fragment處選擇替換片段的另外一個質(zhì)粒圖譜。此時彈出另外一個質(zhì)粒圖譜圖樣。
4. 點(diǎn)擊用于替換的片段,觀察該片段閱讀方向與被替換質(zhì)粒位點(diǎn)的方向是否一致,如不一致,點(diǎn)擊更換方向。
5. 選擇后,點(diǎn)擊Product,點(diǎn)擊Choose Overlapping PCR Primers,此時即形成融合后的質(zhì)粒圖譜。
6.若想獲得引物的序列,點(diǎn)擊Primers→Export Selected Primers,選擇保存。
菜單中英文對照
菜單項(xiàng):
1.file文件
new dna file:打開一個新的dna文件(可以選擇是鏈狀的還是環(huán)狀的)
new file from selection 選取一段序列做為一個新文件
import from genbank :輸入genbank號 即可屬于序列
blast :基因序列和蛋白序列進(jìn)行blast對比
2.edit編輯
copy top strand 復(fù)制頂鏈
copy bottom strand 復(fù)制低鏈
paste reverse complement 復(fù)制反向互補(bǔ)鏈
select all 全選
select range 選中你要求的序列
make uppercase 大寫
make lowercase 小寫
insert bases 插入基因
edit dna ends 編輯dna末端
change methylation 改變甲基化(酶切位點(diǎn)可能有影響)
find 查找基因序列
go to 達(dá)到對應(yīng)號碼的基因
3.view查看
map 顯示圖譜
sequence 顯示序列
enzymes 顯示酶切位點(diǎn)
features 顯示特征序列
show top toolbars 顯示頂部工具
show side toolbars 顯示側(cè)端工具
customize top toolbar自定義頂部工具欄
description panel 說明面板
zoom controls 焦距控制
font size 字體大小
map/sequence options 圖譜和序列設(shè)定
translation options 翻譯設(shè)定
flip sequence 翻轉(zhuǎn)序列
set origin 設(shè)定原點(diǎn)
align with a sequence trace 跟另一個序列對比
4.enzymes:都是關(guān)于酶切位點(diǎn)的,很簡單,第一次用的時候選擇常用酶切位點(diǎn),保存設(shè)置。
5.features
6.primers
7.actions
下載地址
人氣軟件
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