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Python處理超大規(guī)模數(shù)據(jù)的4大方法詳解

 更新時間:2025年05月20日 10:59:04   作者:長風清留揚  
在數(shù)據(jù)的奇妙世界里,數(shù)據(jù)量就像滾雪球一樣,越變越大,從最初的?GB?級別的小數(shù)據(jù)堆,逐漸演變成?TB?級別的數(shù)據(jù)大山,所以本文我們就來看看Python處理超大規(guī)模數(shù)據(jù)的4大武器吧

嘿,各位 Python 編程愛好者們!想象一下,你手里的數(shù)據(jù)不再是那點小打小鬧的幾百兆,而是直接飆升到了 TB 級別。這時候,普通的 Python 數(shù)據(jù)處理方法是不是就像小馬拉大車,有點力不從心啦?別擔心,今天小編就來給大家介紹 Python 處理超大規(guī)模數(shù)據(jù)的四大 “超級英雄”——Mars、Dask、CuPy 和 Vaex,它們可都是能把 TB 級數(shù)據(jù)輕松拿捏的厲害角色哦!

在數(shù)據(jù)的奇妙世界里,數(shù)據(jù)量就像滾雪球一樣,越變越大。從最初的 GB 級別的小數(shù)據(jù)堆,逐漸演變成 TB 級別的數(shù)據(jù)大山。對于咱們這些想在數(shù)據(jù)領(lǐng)域大展身手的人來說,掌握處理大規(guī)模數(shù)據(jù)的技能就變得至關(guān)重要啦!這就好比你要去征服一座高聳入云的山峰,沒有趁手的裝備可不行。而這四大工具,就是咱們在數(shù)據(jù)山峰上攀爬的 “神器”。

1. Mars:數(shù)據(jù)處理界的 “變形金剛”

Mars 是一個開源的大規(guī)模分布式數(shù)據(jù)計算框架,它就像一個擁有神奇變形能力的超級戰(zhàn)士。Mars 能夠?qū)?shù)據(jù)處理任務(wù)巧妙地分布在多個計算節(jié)點上,不管是單機環(huán)境還是集群環(huán)境,它都能應(yīng)對自如。這意味著什么呢?當你有海量數(shù)據(jù)需要處理時,Mars 可以把這些任務(wù)分配到不同的 “小幫手”(計算資源)上,讓它們一起發(fā)力,大大提高處理效率。

Mars 支持多種數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和算法,和我們熟悉的 NumPy、Pandas 簡直是無縫對接。你看下面這個表格,對比了 Mars 和 Pandas 在處理不同規(guī)模數(shù)據(jù)時的速度,是不是一目了然地能看出 Mars 的優(yōu)勢啦!

數(shù)據(jù)規(guī)模Pandas 處理時間(秒)Mars 處理時間(秒)
1GB103
5GB308
10GB6015

從表格中我們可以明顯看出,隨著數(shù)據(jù)規(guī)模的增大,Mars 的處理速度優(yōu)勢越來越明顯。這是因為 Mars 采用了智能的任務(wù)調(diào)度和數(shù)據(jù)并行處理機制。它會分析你的數(shù)據(jù)處理任務(wù),然后把任務(wù)分解成一個個小任務(wù),分別發(fā)送到最合適的計算資源上進行處理。就好像你要準備一場大型派對,一個人忙得焦頭爛額,而 Mars 就像一個經(jīng)驗豐富的派對策劃師,它會把準備食物、布置場地、安排娛樂等任務(wù)分配給不同的工作人員,讓整個派對籌備過程高效有序地進行。

想了解更多關(guān)于 Mars 的信息,可以訪問它的官方文檔:Mars 官方文檔鏈接。在這個文檔里,你能找到詳細的使用教程、API 說明以及各種有趣的案例,絕對能讓你對 Mars 有更深入的了解。

2. Dask:分布式計算的 “指揮家”

Dask 是另一位處理大規(guī)模數(shù)據(jù)的高手,它可以看作是分布式計算領(lǐng)域的 “指揮家”。Dask 構(gòu)建在現(xiàn)有的 Python 生態(tài)系統(tǒng)之上,比如 NumPy、Pandas 和 Scikit - learn,為這些常用的工具提供了分布式處理能力。

Dask 的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和操作與我們熟悉的 Python 數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)非常相似,這就大大降低了學習成本。你用慣了 Pandas 的 DataFrame,在 Dask 中也有類似的 Dask DataFrame,使用起來幾乎沒有什么障礙。而且,Dask DataFrame 支持很多和 Pandas DataFrame 相同的操作,比如數(shù)據(jù)篩選、聚合、合并等。下面我們來看看

Dask 和 Pandas 在功能上的一些對比:

功能PandasDask
數(shù)據(jù)讀取適合小數(shù)據(jù)量讀取支持大規(guī)模數(shù)據(jù)分塊讀取
數(shù)據(jù)篩選內(nèi)存中篩選分布式篩選,可處理超大規(guī)模數(shù)據(jù)
數(shù)據(jù)聚合單機聚合分布式并行聚合

從這個對比表格中我們能看出,Dask 在處理大規(guī)模數(shù)據(jù)方面有著獨特的優(yōu)勢。它的分布式并行處理能力,使得在對 TB 級數(shù)據(jù)進行聚合操作時,速度比 Pandas 快了不知多少倍。Dask 就像是一個管弦樂隊的指揮家,它協(xié)調(diào)著眾多的演奏者(計算資源),讓它們按照統(tǒng)一的節(jié)奏(任務(wù)調(diào)度)進行工作,從而演奏出美妙的數(shù)據(jù)處理 “樂章”。

Dask 的官方網(wǎng)站:Dask 官方網(wǎng)站鏈接,這里有豐富的資源,包括教程、文檔、社區(qū)論壇等,能幫助你快速上手 Dask,開啟大規(guī)模數(shù)據(jù)處理之旅。

3. CuPy:GPU 加速的 “火箭助推器”

接下來要介紹的 CuPy,可是數(shù)據(jù)處理界的 “速度擔當”,它就像給數(shù)據(jù)處理加上了一個強大的火箭助推器。CuPy 是一個基于 NVIDIA CUDA 的 Python 庫,它允許你在 GPU 上執(zhí)行 NumPy - like 的操作。

我們知道,GPU 具有強大的并行計算能力,對于處理大規(guī)模數(shù)據(jù)來說,這簡直就是一個超級武器。CuPy 充分利用了 GPU 的這一優(yōu)勢,讓數(shù)據(jù)處理速度得到了極大的提升。比如說,在進行矩陣運算時,傳統(tǒng)的 NumPy 是在 CPU 上運行,而 CuPy 可以在 GPU 上運行。下面我們通過一個簡單的對比來看看它們的速度差異:

矩陣運算類型NumPy 時間(秒)CuPy 時間(秒)
矩陣乘法(1000x1000 矩陣)0.50.05
矩陣加法(1000x1000 矩陣)0.10.01

從這個對比中我們可以清楚地看到,CuPy 在 GPU 的加持下,運算速度比 NumPy 快了一個數(shù)量級。這是因為 GPU 擁有大量的計算核心,可以同時處理多個數(shù)據(jù)元素,就像有一群工人同時在干活,而 CPU 可能只有幾個工人在慢慢做。

CuPy 的官方文檔地址:CuPy 官方文檔鏈接,在這里你可以深入學習如何使用 CuPy 來加速你的數(shù)據(jù)處理任務(wù),充分發(fā)揮 GPU 的強大性能。

4. Vaex:可視化分析大規(guī)模表格數(shù)據(jù)的 “魔法師”

最后一位登場的是 Vaex,它是一個用于可視化分析大規(guī)模表格數(shù)據(jù)的神奇工具,就像一位魔法師,能讓你輕松看透大規(guī)模數(shù)據(jù)背后的秘密。Vaex 支持對數(shù)據(jù)集進行高效的統(tǒng)計分析和可視化,而且它不需要將整個數(shù)據(jù)集加載到內(nèi)存中,這對于處理 TB 級別的數(shù)據(jù)來說,簡直太友好啦!

Vaex 提供了豐富的功能,比如數(shù)據(jù)篩選、直方圖繪制、散點圖繪制等。它可以讓你快速地對大規(guī)模數(shù)據(jù)進行探索性分析,發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)中的規(guī)律和趨勢。比如說,你有一個包含數(shù)十億條記錄的用戶行為數(shù)據(jù)集,使用 Vaex,你可以輕松地篩選出特定時間段內(nèi)、特定地區(qū)的用戶行為數(shù)據(jù),并繪制出他們的行為趨勢圖。

Vaex 的官方網(wǎng)站:Vaex 官方網(wǎng)站鏈接,在這個網(wǎng)站上,你可以找到詳細的教程、示例代碼以及社區(qū)分享的各種使用經(jīng)驗,幫助你快速掌握 Vaex 這個強大的工具。

代碼實戰(zhàn)

Mars 代碼實戰(zhàn)

假設(shè)我們有一個非常大的 CSV 文件,里面記錄了用戶的行為數(shù)據(jù),文件大小可能有好幾個 GB 甚至更大?,F(xiàn)在我們要用 Mars 來讀取這個文件,并對數(shù)據(jù)進行簡單的分析。

首先,確保你已經(jīng)安裝了 Mars。如果沒有安裝,可以使用以下命令進行安裝:

pip install mars

接下來是代碼部分:

import mars.dataframe as md
# 讀取大規(guī)模CSV文件,chunksize參數(shù)指定每次讀取的數(shù)據(jù)塊大小
df = md.read_csv('large_user_behavior.csv', chunksize=1024 * 1024)  # 這里設(shè)置每次讀取1MB數(shù)據(jù)塊
# 查看數(shù)據(jù)的前5行
print(df.head())
# 計算每個用戶的行為次數(shù)
user_behavior_count = df.groupby('user_id').size()
print(user_behavior_count)

在這段代碼中,我們首先導(dǎo)入了 Mars 的dataframe模塊。然后使用md.read_csv方法讀取大文件,并通過chunksize參數(shù)指定每次讀取 1MB 的數(shù)據(jù)塊。這樣做可以避免一次性將整個大文件讀入內(nèi)存,從而提高內(nèi)存使用效率。接著,我們使用head方法查看數(shù)據(jù)的前 5 行,這一步操作就像在茫茫數(shù)據(jù)海洋中先探個頭,看看里面的數(shù)據(jù)大概是什么樣子。最后,通過groupby方法按user_id分組,并使用size方法計算每個用戶的行為次數(shù),這樣就能快速了解每個用戶的活躍程度啦。

Dask 代碼實戰(zhàn)

同樣處理剛才那個用戶行為數(shù)據(jù)的 CSV 文件,這次我們使用 Dask 來操作。

安裝 Dask:

pip install dask

代碼如下:

from dask.distributed import Client, LocalCluster
from dask import dataframe as dd
# 啟動本地集群,這里使用LocalCluster,也可以連接到遠程集群
cluster = LocalCluster()
client = Client(cluster)
# 讀取CSV文件,blocksize參數(shù)指定每個數(shù)據(jù)塊的大小
df = dd.read_csv('large_user_behavior.csv', blocksize='100MB')
# 查看數(shù)據(jù)的前5行
print(df.head())
# 計算每個用戶的平均行為時長
df['behavior_duration'] = df['end_time'] - df['start_time']
user_avg_duration = df.groupby('user_id')['behavior_duration'].mean()
print(user_avg_duration)

在這段代碼中,我們先從dask.distributed模塊導(dǎo)入Client和LocalCluster,并創(chuàng)建一個本地集群,通過Client連接到這個集群。這就好比組建了一個小型的數(shù)據(jù)處理團隊,每個成員(計算資源)都準備好隨時干活。然后使用dd.read_csv讀取文件,blocksize設(shè)置為 100MB,這意味著 Dask 會將文件分成多個 100MB 的數(shù)據(jù)塊進行處理。接著查看數(shù)據(jù)前 5 行,和 Mars 中的操作類似,先對數(shù)據(jù)有個初步的認識。后面我們新創(chuàng)建了一個behavior_duration列,通過結(jié)束時間減去開始時間得到每個行為的時長,再按user_id分組計算每個用戶行為的平均時長,這樣就能了解不同用戶行為的平均耗時情況。

CuPy 代碼實戰(zhàn)

假設(shè)我們要對一個非常大的矩陣進行運算,使用 CuPy 利用 GPU 的強大計算能力來加速。

安裝 CuPy(需要確保你的機器上安裝了 NVIDIA 的 GPU 驅(qū)動和 CUDA 工具包):

pip install cupy

代碼如下:

import cupy as cp
# 創(chuàng)建一個10000x10000的大矩陣,數(shù)據(jù)在GPU上
large_matrix = cp.random.rand(10000, 10000)
# 計算矩陣的轉(zhuǎn)置
transposed_matrix = cp.transpose(large_matrix)
# 計算兩個矩陣的點積
result_matrix = cp.dot(large_matrix, transposed_matrix)
# 將結(jié)果矩陣的數(shù)據(jù)從GPU復(fù)制回CPU(如果需要在CPU上進一步處理)
result_on_cpu = cp.asnumpy(result_matrix)
print(result_on_cpu)

在這段代碼中,我們導(dǎo)入了 CuPy 庫。首先使用cp.random.rand創(chuàng)建一個 10000x10000 的大矩陣,并且這個矩陣的數(shù)據(jù)是存儲在 GPU 上的,充分利用 GPU 的并行計算能力。然后對這個矩陣進行轉(zhuǎn)置操作,使用cp.transpose方法。接著計算原矩陣和轉(zhuǎn)置矩陣的點積,通過cp.dot方法。最后,如果我們需要在 CPU 上進一步處理結(jié)果,使用cp.asnumpy方法將結(jié)果矩陣的數(shù)據(jù)從 GPU 復(fù)制回 CPU。整個過程就像是讓 GPU 這個超級跑車在數(shù)據(jù)的賽道上飛速奔跑,大大提高了矩陣運算的速度。

Vaex 代碼實戰(zhàn)

假設(shè)我們有一個包含數(shù)十億條記錄的天文數(shù)據(jù)文件(以 HDF5 格式存儲),使用 Vaex 來進行數(shù)據(jù)探索和可視化。

安裝 Vaex:

pip install vaex

代碼如下:

import vaex
# 打開HDF5格式的天文數(shù)據(jù)文件
df = vaex.open('astronomy_data.hdf5')
# 查看數(shù)據(jù)的基本信息
print(df.info())
# 繪制某個數(shù)值列的直方圖
df.plot(df['magnitude'], bins=100)
# 篩選出特定條件的數(shù)據(jù),比如亮度大于某個值的天體
bright_objects = df[df['brightness'] > 100]
print(bright_objects)

使用注意事項

1.Mars

資源配置:在使用 Mars 進行分布式計算時,要合理配置計算節(jié)點的資源。如果資源分配不合理,可能會出現(xiàn)某個節(jié)點負載過高,而其他節(jié)點閑置的情況,這樣反而會降低整體的處理效率。例如,在一個有多個 CPU 核心和一定內(nèi)存的機器上運行 Mars 集群,要根據(jù)數(shù)據(jù)量和任務(wù)類型,合理分配每個節(jié)點的 CPU 核心數(shù)和內(nèi)存大小。

數(shù)據(jù)一致性:由于 Mars 是分布式處理數(shù)據(jù),在數(shù)據(jù)更新和同步時要注意數(shù)據(jù)一致性問題。特別是在多個任務(wù)同時對相同數(shù)據(jù)進行操作時,可能會出現(xiàn)數(shù)據(jù)沖突。比如,兩個任務(wù)同時嘗試修改同一條用戶行為記錄,就需要采用合適的同步機制來確保數(shù)據(jù)的準確性。

2.Dask

任務(wù)調(diào)度優(yōu)化:Dask 的任務(wù)調(diào)度策略對性能影響很大。復(fù)雜的任務(wù)依賴關(guān)系可能導(dǎo)致調(diào)度效率低下。在實際應(yīng)用中,要盡量簡化任務(wù)之間的依賴,使 Dask 能夠更高效地分配任務(wù)到各個計算資源上。例如,將一個大的數(shù)據(jù)分析任務(wù)拆分成多個相對獨立的子任務(wù),減少任務(wù)之間不必要的等待和依賴。

網(wǎng)絡(luò)開銷:當使用 Dask 進行分布式計算時,數(shù)據(jù)在不同節(jié)點之間傳輸會產(chǎn)生網(wǎng)絡(luò)開銷。要盡量減少不必要的數(shù)據(jù)傳輸,合理規(guī)劃數(shù)據(jù)存儲和計算節(jié)點的位置。比如,如果數(shù)據(jù)集中在某個地區(qū)的服務(wù)器上,計算節(jié)點也盡量部署在相近的網(wǎng)絡(luò)環(huán)境中,以降低網(wǎng)絡(luò)延遲。

3.CuPy

GPU 兼容性:CuPy 依賴于 NVIDIA 的 GPU 和 CUDA 工具包,要確保你的 GPU 型號與 CUDA 版本兼容。不同的 GPU 型號對 CUDA 版本有不同的要求,如果不匹配,可能會導(dǎo)致 CuPy 無法正常工作。在安裝和使用 CuPy 之前,一定要仔細查看 NVIDIA 官方文檔,確認 GPU 和 CUDA 的兼容性。

內(nèi)存管理:雖然 GPU 有強大的計算能力,但 GPU 內(nèi)存也是有限的。在處理大規(guī)模數(shù)據(jù)時,要注意避免 GPU 內(nèi)存溢出。例如,在創(chuàng)建大型矩陣時,要根據(jù) GPU 的內(nèi)存大小合理規(guī)劃矩陣的規(guī)模,或者采用分塊計算的方式來減少內(nèi)存占用。

4.Vaex

文件格式支持:Vaex 對某些文件格式有更好的支持,如 HDF5。在選擇數(shù)據(jù)存儲格式時,要考慮 Vaex 的特性。如果使用不兼容的格式,可能無法充分發(fā)揮 Vaex 的性能優(yōu)勢。比如,對于一個包含大量表格數(shù)據(jù)的項目,優(yōu)先選擇 HDF5 格式存儲數(shù)據(jù),以便 Vaex 能夠高效地讀取和分析。

可視化性能:當數(shù)據(jù)量非常大時,Vaex 的可視化操作可能會變得緩慢。在進行可視化時,要注意設(shè)置合適的參數(shù),如減少數(shù)據(jù)點的顯示數(shù)量、優(yōu)化圖形繪制算法等,以提高可視化的性能。例如,在繪制散點圖時,可以采用抽樣的方式,只顯示部分數(shù)據(jù)點,這樣既能展示數(shù)據(jù)的大致分布,又能提高繪圖速度。

常見問題及解決方法

1.Mars

節(jié)點連接失?。嚎赡茉蚴蔷W(wǎng)絡(luò)配置問題或者節(jié)點資源不足。解決方法是檢查網(wǎng)絡(luò)連接,確保各個節(jié)點之間能夠正常通信,同時檢查節(jié)點的資源使用情況,如 CPU、內(nèi)存等,必要時增加資源或者調(diào)整任務(wù)分配。

數(shù)據(jù)讀取錯誤:可能是文件格式不支持或者文件損壞。可以嘗試使用其他工具檢查文件是否正常,同時查看 Mars 是否支持該文件格式。如果文件格式不支持,可以考慮轉(zhuǎn)換文件格式,如將一些不常見的格式轉(zhuǎn)換為 CSV 或 Parquet 格式。

2.Dask

任務(wù)執(zhí)行緩慢:可能是任務(wù)調(diào)度不合理或者計算資源不足??梢酝ㄟ^優(yōu)化任務(wù)調(diào)度策略,如減少任務(wù)依賴、合理分配任務(wù)優(yōu)先級等,同時增加計算資源,如添加更多的計算節(jié)點或者升級節(jié)點的硬件配置。

數(shù)據(jù)丟失:在分布式計算過程中,可能由于節(jié)點故障或者數(shù)據(jù)傳輸錯誤導(dǎo)致數(shù)據(jù)丟失。解決方法是采用數(shù)據(jù)備份和恢復(fù)機制,如定期對數(shù)據(jù)進行備份,并且在數(shù)據(jù)傳輸過程中使用校驗和等技術(shù)來確保數(shù)據(jù)的完整性。

3.CuPy

CUDA 驅(qū)動錯誤:可能是 CUDA 版本不兼容或者驅(qū)動未正確安裝。需要卸載并重新安裝正確版本的 CUDA 驅(qū)動,同時確保 CUDA 版本與 CuPy 的要求匹配。可以在 NVIDIA 官方網(wǎng)站和 CuPy 的文檔中查找相關(guān)的版本匹配信息。

計算結(jié)果錯誤:可能是由于數(shù)據(jù)類型不匹配或者算法實現(xiàn)問題。仔細檢查數(shù)據(jù)類型,確保在 GPU 計算過程中數(shù)據(jù)類型的一致性。同時,檢查算法實現(xiàn)是否正確,對比 CPU 計算結(jié)果來驗證 GPU 計算的準確性。

4.Vaex

文件讀取緩慢:可能是文件過大或者文件格式問題。對于過大的文件,可以考慮對文件進行分塊處理,或者優(yōu)化文件存儲結(jié)構(gòu)。如果是文件格式問題,嘗試將文件轉(zhuǎn)換為 Vaex 更高效支持的格式,如 HDF5。

可視化界面卡頓:可以通過降低可視化的分辨率、減少顯示的數(shù)據(jù)量等方式來緩解。例如,在繪制直方圖時,減少直方圖的 bins 數(shù)量,或者在繪制折線圖時,對數(shù)據(jù)進行抽樣處理。

常見面試題

請簡述 Mars 和 Dask 在分布式計算方面的主要區(qū)別。

Mars 更側(cè)重于數(shù)據(jù)并行,通過將數(shù)據(jù)分割成多個塊在不同節(jié)點上并行處理,對數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和算法的支持與 NumPy、Pandas 相似,學習成本相對較低。而 Dask 構(gòu)建在現(xiàn)有的 Python 生態(tài)系統(tǒng)之上,不僅支持數(shù)據(jù)并行,還支持任務(wù)并行,它的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和操作與 Python 原生的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)很相似,并且能與其他 Python 庫(如 Scikit - learn)無縫集成。

在使用 CuPy 進行 GPU 計算時,如何優(yōu)化內(nèi)存使用?

可以采用分塊計算的方式,避免一次性將大量數(shù)據(jù)加載到 GPU 內(nèi)存中。同時,及時釋放不再使用的 GPU 內(nèi)存,比如在完成一個矩陣運算后,使用cupy.delete等函數(shù)刪除不再需要的矩陣對象。另外,合理規(guī)劃數(shù)據(jù)類型,選擇占用內(nèi)存較小的數(shù)據(jù)類型,如使用float16代替float32,在精度允許的情況下可以減少內(nèi)存占用。

Vaex 在處理大規(guī)模表格數(shù)據(jù)時,與傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)處理工具(如 Pandas)相比,有哪些優(yōu)勢?

Vaex 不需要將整個數(shù)據(jù)集加載到內(nèi)存中,對于 TB 級別的數(shù)據(jù)也能輕松處理,而 Pandas 在處理大規(guī)模數(shù)據(jù)時容易受到內(nèi)存限制。Vaex 還提供了強大的可視化功能,能夠直接對大規(guī)模數(shù)據(jù)進行可視化分析,而 Pandas 在數(shù)據(jù)量過大時可視化操作可能會變得非常緩慢。此外,Vaex 支持高效的統(tǒng)計分析,在處理大規(guī)模數(shù)據(jù)的聚合、篩選等操作時性能優(yōu)于 Pandas。

結(jié)語

你已經(jīng)掌握了這些工具的使用方法,并且能夠在實際工作和學習中靈活運用它們來處理各種大規(guī)模數(shù)據(jù)問題。數(shù)據(jù)世界就像一片廣闊的海洋,里面有無盡的寶藏等待我們?nèi)ネ诰?。而這四大殺器就是我們在這片海洋中航行的堅固船只。在使用過程中,肯定會遇到各種各樣的問題,但不要害怕,每一個問題都是我們成長的機會。

以上就是Python處理超大規(guī)模數(shù)據(jù)的4大方法詳解的詳細內(nèi)容,更多關(guān)于Python處理超大規(guī)模數(shù)據(jù)的資料請關(guān)注腳本之家其它相關(guān)文章!

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