快捷導(dǎo)航

Pandas DataFrame數(shù)據(jù)存儲格式比較分析

更新時間：2023年09月05日 16:16:11 作者：deephub

Pandas 支持多種存儲格式,在本文中將對不同類型存儲格式下的Pandas Dataframe的讀取速度、寫入速度和大小的進(jìn)行測試對比,有需要的朋友可以借鑒參考下,希望能夠有所幫助

創(chuàng)建測試Dataframe

首先創(chuàng)建一個包含不同類型數(shù)據(jù)的測試Pandas Dataframe。

import pandas as pd
 import random
 import string
 import numpy as np
 # Config DF
 df_length= 10**6
 start_date= '2023-01-01'
 all_string= list(string.ascii_letters + string.digits)
 string_length= 10**1
 min_number= 0
 max_number= 10**3
 # Create Columns
 date_col= pd.date_range(start= start_date, periods= df_length, freq= 'H')
 str_col= [''.join(np.random.choice(all_string, string_length)) for i in range(df_length)]
 float_col= np.random.rand(df_length)
 int_col= np.random.randint(min_number,max_number, size = df_length)
 # Create DataFrame
 df= pd.DataFrame({'date_col' : date_col, 
                   'str_col' : str_col, 
                   'float_col' : float_col, 
                   'int_col' : int_col})
 df.info()
 df.head()

以不同的格式存儲

接下來創(chuàng)建測試函數(shù)，以不同的格式進(jìn)行讀寫。

import time 
 import os
 def check_read_write_size(df, file_name, compression= None) :
     format= file_name.split('.')[-1]
     # Write
     begin= time.time()
     if file_name.endswith('.csv') : df.to_csv(file_name, index= False, compression= compression)
     elif file_name.endswith('.parquet') : df.to_parquet(file_name, compression= compression)
     elif file_name.endswith('.pickle') : df.to_pickle(file_name, compression= compression)
     elif file_name.endswith('.orc') : df.to_orc(file_name)
     elif file_name.endswith('.feather') : df.to_feather(file_name)
     elif file_name.endswith('.h5') : df.to_hdf(file_name, key= 'df')
     write_time= time.time() - begin
     # Read
     begin= time.time()
     if file_name.endswith('.csv') : pd.read_csv(file_name, compression= compression)
     elif file_name.endswith('.parquet') : pd.read_parquet(file_name)
     elif file_name.endswith('.pickle') : pd.read_pickle(file_name, compression= compression)
     elif file_name.endswith('.orc') : pd.read_orc(file_name)
     elif file_name.endswith('.h5') : pd.read_hdf(file_name)
     read_time= time.time() - begin
     # File Size
     file_size_mb = os.path.getsize(file_name) / (1024 * 1024)
     return [format, compression, read_time, write_time, file_size_mb]

然后運(yùn)行該函數(shù)并將結(jié)果存儲在另一個Pandas Dataframe中。

test_case= [
             ['df.csv','infer'],
             ['df.csv','gzip'],
             ['df.pickle','infer'],
             ['df.pickle','gzip'],
             ['df.parquet','snappy'],
             ['df.parquet','gzip'],
             ['df.orc','default'],
             ['df.feather','default'],
             ['df.h5','default'],
             ]
 
 result= []
 for i in test_case :
     result.append(check_read_write_size(df, i[0], compression= i[1]))
 
 result_df= pd.DataFrame(result, columns= ['format','compression','read_time','write_time','file_size'])
 result_df