R語言實現(xiàn)地理加權回歸(GWR)
地理加權回歸(GWR)
地理加權回歸(Geographically Weighted Regression,簡稱GWR)是一種用于解釋地理空間數(shù)據(jù)的統(tǒng)計方法。它是多元線性回歸的一種擴展,允許模型的參數(shù)在空間上變化,以更好地捕捉地理數(shù)據(jù)的空間異質(zhì)性。
GWR 考慮了地理位置的影響,認為不同地理位置的數(shù)據(jù)可能具有不同的關系,因此在不同地點擬合不同的回歸模型。這使得 GWR 能夠更好地分析和解釋空間數(shù)據(jù)的變化。在 GWR 中,回歸系數(shù)是空間上的可變參數(shù),根據(jù)地理位置的不同而變化。
GWR 可以用于各種領域,如城市規(guī)劃、地理信息系統(tǒng)(GIS)、環(huán)境科學等,以研究地理位置對某個變量的影響。通過考慮空間變異性,GWR 可以提供更準確的空間預測和更深入的空間數(shù)據(jù)分析。
操作流程
1、導入包
導入了必要的R包,包括GWmodel
用于GWR分析和sf
用于處理地理空間數(shù)據(jù)。
library(GWmodel) library(sf)
2、讀取shp數(shù)據(jù)
讀取了一個名為"Watershed"的Shapefile文件,將其轉換為Spatial
對象,并繪制了地圖。
ES <- st_read(dsn = getwd(), layer = "Watershed") %>% as("Spatial") plot(ES)
3、確定最優(yōu)帶寬(bandwidth)
計算地理加權回歸(GWR)中的bw
(帶寬)通常需要一些經(jīng)驗和試驗,因為它決定了權重在空間上的分布。帶寬控制了模型中每個數(shù)據(jù)點周圍的鄰域大小,從而影響了模型的擬合。以下是一些常見的方法來計算bw
帶寬:
- Cross-Validation(交叉驗證): 交叉驗證是一種常見的方法,用于確定最優(yōu)的帶寬值。你可以嘗試不同的帶寬值,然后對每個值進行交叉驗證,選擇具有最佳性能的帶寬。
- AIC(赤池信息準則)或BIC(貝葉斯信息準則): 這些信息準則可以用于選擇最合適的帶寬。你可以計算不同帶寬下的AIC或BIC值,并選擇具有最小值的帶寬。
- 經(jīng)驗法: 根據(jù)你的研究領域和數(shù)據(jù)特點,可以使用一些經(jīng)驗法來選擇帶寬。例如,使用平均最短距離(average nearest neighbor distance)或使用空間數(shù)據(jù)的密度來估計帶寬。
- 參考文獻和先前研究: 查閱與你的研究類似的文獻,了解其他研究中使用的帶寬值。這可以作為一個起點來選擇帶寬。
- 試驗法: 嘗試不同的帶寬值,然后評估模型的性能??梢岳L制擬合的殘差圖、R-squared值等指標,以判斷哪個帶寬值最適合你的數(shù)據(jù)。
- 自適應帶寬(Adaptive Bandwidth): 使用自適應帶寬方法,其中帶寬值根據(jù)數(shù)據(jù)的密度和分布自動調(diào)整。這可以通過設置
adaptive = TRUE
和提供適當?shù)淖赃m應函數(shù)來實現(xiàn)。
注意,不同的數(shù)據(jù)和研究問題可能需要不同的帶寬選擇方法。通常,建議嘗試多種方法,并根據(jù)模型的性能和數(shù)據(jù)的特點來選擇最合適的帶寬值。通過交叉驗證等方法可以幫助你更好地確定合適的帶寬。在R中,你可以使用gwr.basic
函數(shù)中的bw
參數(shù)來指定帶寬值,然后根據(jù)你選擇的方法確定這個值。
使用AIC方法計算了最佳帶寬值,然后將其打印出來。
bw.AB<-bw.gwr(A~B,data = ES, approach = "aic", adaptive = F, kernel = "gaussian") bw.AB
[1] 22348.91
bw.gwr
函數(shù)是"GWmodel"包中用于帶寬選擇的函數(shù),它用于計算地理加權回歸(GWR)中的最佳帶寬(bandwidth)值。
bw.gwr( formula, data, family = gaussian(), kernel = "gaussian", adaptive = FALSE, approach = "AIC", fixed = FALSE, minB = 0.1, maxB = 0.9, longlat = NULL, search.method = "grid", percentiles = NULL, ...)
formula
: 一個公式,指定了回歸模型的結構,例如y ~ x1 + x2 + xn
,其中y
是因變量,x1
,x2
,xn
是自變量。data
: 包含因變量和自變量的數(shù)據(jù)框。family
: 用于指定模型的誤差分布。默認是正態(tài)分布(gaussian()
),但你也可以使用其他分布,如泊松分布或二項分布,根據(jù)你的數(shù)據(jù)類型選擇適當?shù)姆植肌?/li>kernel
: 用于計算權重的核函數(shù)。通常使用的核函數(shù)有"Gauss"(高斯核)和"Bisquare"(雙二次核)。你可以根據(jù)你的研究需求選擇不同的核函數(shù)。adaptive
: 一個邏輯值,表示是否使用自適應帶寬。如果為TRUE
,帶寬將根據(jù)數(shù)據(jù)的密度在空間上自適應調(diào)整。approach
: 用于帶寬選擇的方法。常用的方法包括"AIC"(赤池信息準則)和"BIC"(貝葉斯信息準則)等。fixed
: 一個邏輯值,表示是否固定帶寬。如果為TRUE
,將使用指定的帶寬值,而不進行帶寬選擇。minB
和maxB
: 用于搜索最佳帶寬的帶寬范圍的最小值和最大值。通常情況下,搜索方法會在這個范圍內(nèi)尋找最佳帶寬。longlat
: 一個邏輯值,表示是否在經(jīng)緯度坐標系中運行。如果為TRUE
,將自動考慮地球的曲率。search.method
: 用于帶寬搜索的方法。常用的方法有"grid"(網(wǎng)格搜索)和"optimize"(優(yōu)化搜索)等。percentiles
: 用于指定帶寬搜索的百分位數(shù),可以用于精細化搜索。...
: 其他參數(shù),用于傳遞給底層函數(shù)。
bw.gwr
函數(shù)執(zhí)行帶寬選擇過程,計算最適合數(shù)據(jù)的帶寬值,以用于后續(xù)的GWR模型擬合。帶寬選擇的方法和參數(shù)可以根據(jù)你的需求進行調(diào)整,以便選擇最佳的帶寬值。該函數(shù)通常用于幫助確定合適的帶寬,以優(yōu)化GWR模型的性能。
運行GWR模型
運行了地理加權回歸(GWR)模型,使用之前計算得到的最佳帶寬值,并繪制了自變量B的回歸系數(shù)圖。最后,將GWR模型結果導出到Shapefile文件中,以便在ArcGIS等GIS軟件中進一步分析和可視化。
AB<-gwr.basic(A~B, data = ES, bw = bw.AB, adaptive = F, kernel = "gaussian") spplot(AB$SDF['B']) #繪圖查看自變量B的回歸系數(shù) gwr.write.shp(AB,fn="AB") #導出到一個shp文件,之后就可以導入到ArcGIS
gwr.basic
函數(shù)是"GWmodel"包中用于執(zhí)行地理加權回歸(GWR)的函數(shù),它執(zhí)行最基本的GWR模型估計。
gwr.basic( formula, data, coords, bw, family = gaussian(), kernel = "gaussian", adaptive = FALSE, ... )
formula
: 一個公式,指定了回歸模型的結構,例如y ~ x1 + x2 + xn
,其中y
是因變量,x1
,x2
,xn
是自變量。data
: 包含因變量和自變量的數(shù)據(jù)框。coords
: 一個包含地理坐標信息的Spatial*DataFrame
對象,或類似的對象。這些坐標將用于地理加權回歸。bw
: 地理權重的帶寬(bandwidth)??梢允且粋€常數(shù)值,也可以是一個向量,用于指定每個數(shù)據(jù)點的帶寬。通常,這是GWR中重要的參數(shù),它控制了權重在空間上的分布。family
: 用于指定模型的誤差分布。默認是正態(tài)分布(gaussian()
),但你也可以使用其他分布,如泊松分布或二項分布,根據(jù)你的數(shù)據(jù)類型選擇適當?shù)姆植肌?/li>kernel
: 用于計算權重的核函數(shù)。通常使用的核函數(shù)有"Gauss"(高斯核)和"Bisquare"(雙二次核)。你可以根據(jù)你的研究需求選擇不同的核函數(shù)。adaptive
: 一個邏輯值,表示是否使用自適應帶寬。如果為TRUE
,帶寬將根據(jù)數(shù)據(jù)的密度在空間上自適應調(diào)整。...
: 其他參數(shù),用于傳遞給底層函數(shù)。
gwr.basic
函數(shù)執(zhí)行GWR模型估計,根據(jù)提供的參數(shù)和數(shù)據(jù)來生成GWR模型。你可以根據(jù)你的研究需求自定義這些參數(shù),以獲得符合你需求的GWR模型。一般來說,你可以查閱"GWmodel"包的文檔以獲取更詳細的信息和示例代碼,以更好地理解如何使用gwr.basic
函數(shù)。這個函數(shù)通常用于擬合地理加權回歸模型并生成模型的擬合結果和統(tǒng)計信息。
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