Pthon批量處理將pdb文件生成dssp文件
更新時間：2015年06月21日 16:22:09 投稿：junjie
這篇文章主要介紹了Pthon批量處理將pdb文件生成dssp文件,通過本例主要學習遍歷目錄下文件的方法,需要的朋友可以參考下
# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Created on Sat Jun 20 19:36:34 2015
@author: chaofn
"""
import os
"""
這個程序的目的是將linux下/ifs/home/fanchao/Manesh_pdb目錄中的所有文件（一共有215個文件）
批處理
將pdb文件生成dssp文件
"""
#listdir返回文件名的列表
fileLine=os.listdir('/ifs/home/fanchao/Manesh_pdb')
#遍歷整個列表
for i in range(len(fileLine)-1):
#將字符串用變量表示
input_file='/ifs/home/fanchao/Manesh_pdb/'+fileLine[i]
#先去掉文件名的后綴，然后形成后綴為dssp的文件名
out_file=fileLine[i].split('.')[0]+'.dssp'
output_file='/ifs/home/fanchao/Manesh_dssp/'+out_file
#注意：參數(shù)的傳遞（先是%s，然后是%變量名），多個變量的傳入要用元組表示，在元組前用%
os.system('/ifs/share/lib/dssp/dssp2 -i %s -o %s' %(input_file,output_file))
相關文章
跳出單循環(huán)不管是什么編程語言,都有可能會有跳出循環(huán)的需求,本文主要介紹了Python中斷多重循環(huán)的幾種方法,具有一定的參考價值,感興趣的可以了解一下2023-11-11
Python如何利用Har文件進行遍歷指定字典替換提交的數(shù)據(jù)詳解
這篇文章主要給大家介紹了關于Python如何利用Har文件進行遍歷指定字典替換提交的數(shù)據(jù)的相關資料，文中通過示例代碼介紹的非常詳細，對大家的學習或者工作具有一定的參考學習價值，需要的朋友們下面隨著小編來一起學習學習吧2020-11-11
Pytorch轉(zhuǎn)keras的有效方法,以FlowNet為例講解
這篇文章主要介紹了Pytorch轉(zhuǎn)keras的有效方法,以FlowNet為例講解，具有很好的參考價值，希望對大家有所幫助。一起跟隨小編過來看看吧2020-05-05
Python使用colorlog實現(xiàn)控制臺管理日志多種顏色顯示
colorlog 是一個 Python 日志庫,它可以讓你在控制臺中以彩色的方式顯示日志消息,使得日志更易于閱讀和理解,下面就跟隨小編一起來看看它的具體應用吧2024-03-03
這篇文章主要介紹了python如何實現(xiàn)單鏈表的反轉(zhuǎn),文中通過示例代碼介紹的非常詳細，對大家的學習或者工作具有一定的參考學習價值,需要的朋友可以參考下2020-02-02
這篇文章主要介紹了聊聊PyTorch中eval和no_grad的關系，具有很好的參考價值，希望對大家有所幫助。一起跟隨小編過來看看吧2021-05-05
這篇文章主要為大家詳細介紹了python使用opencv按一定間隔截取視頻幀，具有一定的參考價值，感興趣的小伙伴們可以參考一下2018-03-03
最近想對python加深學習一下，同時也是想試著做一些東西，所以使用python,結(jié)合Tkinter來做一個簡單的跨平臺記事本。最終實現(xiàn)的記事本如下，也算是麻雀雖小，五臟俱全了，之后也是會繼續(xù)完善的。文中通過圖文及示例代碼介紹的很詳細，有需要的朋友們可以參考借鑒。2016-11-11
這篇文章主要介紹了Keras 多次加載model出錯的解決方案，具有很好的參考價值，希望對大家有所幫助。如有錯誤或未考慮完全的地方，望不吝賜教2021-05-05
本文主要介紹了opencv去除背景算法的方法比較，文中通過示例代碼介紹的非常詳細，對大家的學習或者工作具有一定的參考學習價值，需要的朋友們下面隨著小編來一起學習學習吧2022-08-08