使用Pytorch+PyG實(shí)現(xiàn)MLP的詳細(xì)過程
我的項(xiàng)目環(huán)境:
- 平臺(tái):Windows10
- 語言環(huán)境:python3.7
- 編譯器:PyCharm
- PyTorch版本:1.11.0
- PyG版本:2.1.0
本文我們將使用Pytorch + Pytorch Geometric來簡易實(shí)現(xiàn)一個(gè)MLP(感知機(jī)網(wǎng)絡(luò)),讓新手可以理解如何PyG來搭建一個(gè)簡易的圖網(wǎng)絡(luò)實(shí)例demo。
一、導(dǎo)入相關(guān)庫
本項(xiàng)目我們需要結(jié)合兩個(gè)庫,一個(gè)是Pytorch,因?yàn)檫€需要按照torch的網(wǎng)絡(luò)搭建模型進(jìn)行書寫,第二個(gè)是PyG,因?yàn)樵趖orch中并沒有關(guān)于圖網(wǎng)絡(luò)層的定義,所以需要torch_geometric這個(gè)庫來定義一些圖層。
import torch import torch.nn.functional as F import torch.nn as nn import torch_geometric.nn as pyg_nn from torch_geometric.datasets import Planetoid
二、加載Cora數(shù)據(jù)集
本文使用的數(shù)據(jù)集是比較經(jīng)典的Cora數(shù)據(jù)集,它是一個(gè)根據(jù)科學(xué)論文之間相互引用關(guān)系而構(gòu)建的Graph數(shù)據(jù)集合,論文分為7類,共2708篇。
- Genetic_Algorithms
- Neural_Networks
- Probabilistic_Methods
- Reinforcement_Learning
- Rule_Learning
- Theory
這個(gè)數(shù)據(jù)集是一個(gè)用于圖節(jié)點(diǎn)分類的任務(wù),數(shù)據(jù)集中只有一張圖,這張圖中含有2708個(gè)節(jié)點(diǎn),10556條邊,每個(gè)節(jié)點(diǎn)的特征維度為1433。
# 1.加載Cora數(shù)據(jù)集 dataset = Planetoid(root='./data/Cora', name='Cora')
三、定義MLP網(wǎng)絡(luò)
這里我們就不重點(diǎn)介紹MLP網(wǎng)絡(luò)了,相信大家能夠掌握基本原理,本文我們使用的是PyG定義網(wǎng)絡(luò)層,在PyG中已經(jīng)定義好了MLP這個(gè)層,該層采用的就是感知機(jī)機(jī)制。
對(duì)于MLP的常用參數(shù):
- channel_list:樣本輸入層、中間層、輸出層維度的列表
- in_channels:每個(gè)樣本的輸入維度,就是每個(gè)節(jié)點(diǎn)的特征維度
- hidden_channels:單層神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中間的隱層大小
- out_channels:經(jīng)過MLP后映射成的新的維度,就是經(jīng)過MLP后每個(gè)節(jié)點(diǎn)的維度長度
- num_layers:感知機(jī)層數(shù)
- dropout:每個(gè)隱藏層的丟棄率,如果存在多層可以使用列表傳入
- act:激活函數(shù),默認(rèn)為relu
- bias:訓(xùn)練一個(gè)偏置b
對(duì)于本文實(shí)現(xiàn)的 pyg_nn.MLP([num_node_features, 32, 64, 128])
的含義就是定義一個(gè)三層的感知機(jī)網(wǎng)絡(luò),按照 PyTorch
實(shí)現(xiàn)等價(jià)于如下代碼:
lin_1 = nn.Linear(num_node_features, 32) lin_2 = nn.Linear(32, 64) lin_3 = nn.Linear(64, 128)
對(duì)于 PyG
中實(shí)現(xiàn)起來較為簡單,以列表方式傳入所以隱層大小即可,第一個(gè)維度代表樣本的輸入特征維度,最后一個(gè)維度代表輸出的維度大小,中間維度代表隱層的大小,所以 len(channel_list) - 1
代表 MLP
的層數(shù),這種方式是以傳入 channel_list
方式定義模型,還可以按照正常參數(shù)方式進(jìn)行傳遞定義,代碼如下:
pyg_nn.MLP(in_channels=16, hidden_channels=32, out_channels=128, num_layers=3)
網(wǎng)絡(luò)定義代碼如下:
# 2.定義MLP網(wǎng)絡(luò) class MLP(nn.Module): def __init__(self, num_node_features, num_classes): super(MLP, self).__init__() self.lin_1 = pyg_nn.MLP([num_node_features, 32, 64, 128]) self.lin_2 = pyg_nn.MLP([128, 64, 32, num_classes]) def forward(self, data): x, edge_index = data.x, data.edge_index x = self.lin_1(x, edge_index) x = F.relu(x) x = F.dropout(x, training=self.training) x = self.lin_2(x, edge_index) return F.log_softmax(x, dim=1)
上面網(wǎng)絡(luò)我們定義了兩個(gè)MLP層,第一層的參數(shù)的輸入維度就是初始每個(gè)節(jié)點(diǎn)的特征維度,輸出維度是128。
第二個(gè)層的輸入維度為128,輸出維度為分類個(gè)數(shù),因?yàn)槲覀冃枰獙?duì)每個(gè)節(jié)點(diǎn)進(jìn)行分類,最終加上softmax操作。
四、定義模型
下面就是定義了一些模型需要的參數(shù),像學(xué)習(xí)率、迭代次數(shù)這些超參數(shù),然后是模型的定義以及優(yōu)化器及損失函數(shù)的定義,和pytorch定義網(wǎng)絡(luò)是一樣的。
device = torch.device('cuda' if torch.cuda.is_available() else 'cpu') # 設(shè)備 epochs = 10 # 學(xué)習(xí)輪數(shù) lr = 0.003 # 學(xué)習(xí)率 num_node_features = dataset.num_node_features # 每個(gè)節(jié)點(diǎn)的特征數(shù) num_classes = dataset.num_classes # 每個(gè)節(jié)點(diǎn)的類別數(shù) data = dataset[0].to(device) # Cora的一張圖 # 3.定義模型 model = MLP(num_node_features, num_classes).to(device) optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=lr) # 優(yōu)化器 loss_function = nn.NLLLoss() # 損失函數(shù)
五、模型訓(xùn)練
模型訓(xùn)練部分也是和pytorch定義網(wǎng)絡(luò)一樣,因?yàn)槎际切枰?jīng)過前向傳播、反向傳播這些過程,對(duì)于損失、精度這些指標(biāo)可以自己添加。
# 訓(xùn)練模式 model.train() for epoch in range(epochs): optimizer.zero_grad() pred = model(data) loss = loss_function(pred[data.train_mask], data.y[data.train_mask]) # 損失 correct_count_train = pred.argmax(axis=1)[data.train_mask].eq(data.y[data.train_mask]).sum().item() # epoch正確分類數(shù)目 acc_train = correct_count_train / data.train_mask.sum().item() # epoch訓(xùn)練精度 loss.backward() optimizer.step() if epoch % 20 == 0: print("【EPOCH: 】%s" % str(epoch + 1)) print('訓(xùn)練損失為:{:.4f}'.format(loss.item()), '訓(xùn)練精度為:{:.4f}'.format(acc_train)) print('【Finished Training!】')
六、模型驗(yàn)證
下面就是模型驗(yàn)證階段,在訓(xùn)練時(shí)我們是只使用了訓(xùn)練集,測試的時(shí)候我們使用的是測試集,注意這和傳統(tǒng)網(wǎng)絡(luò)測試不太一樣,在圖像分類一些經(jīng)典任務(wù)中,我們是把數(shù)據(jù)集分成了兩份,分別是訓(xùn)練集、測試集,但是在Cora這個(gè)數(shù)據(jù)集中并沒有這樣,它區(qū)分訓(xùn)練集還是測試集使用的是掩碼機(jī)制,就是定義了一個(gè)和節(jié)點(diǎn)長度相同緯度的數(shù)組,該數(shù)組的每個(gè)位置為True或者False,標(biāo)記著是否使用該節(jié)點(diǎn)的數(shù)據(jù)進(jìn)行訓(xùn)練。
# 模型驗(yàn)證 model.eval() pred = model(data) # 訓(xùn)練集(使用了掩碼) correct_count_train = pred.argmax(axis=1)[data.train_mask].eq(data.y[data.train_mask]).sum().item() acc_train = correct_count_train / data.train_mask.sum().item() loss_train = loss_function(pred[data.train_mask], data.y[data.train_mask]).item() # 測試集 correct_count_test = pred.argmax(axis=1)[data.test_mask].eq(data.y[data.test_mask]).sum().item() acc_test = correct_count_test / data.test_mask.sum().item() loss_test = loss_function(pred[data.test_mask], data.y[data.test_mask]).item() print('Train Accuracy: {:.4f}'.format(acc_train), 'Train Loss: {:.4f}'.format(loss_train)) print('Test Accuracy: {:.4f}'.format(acc_test), 'Test Loss: {:.4f}'.format(loss_test))
七、結(jié)果
【EPOCH: 】1
訓(xùn)練損失為:1.9856 訓(xùn)練精度為:0.1786
【EPOCH: 】21
訓(xùn)練損失為:1.5419 訓(xùn)練精度為:0.4643
【EPOCH: 】41
訓(xùn)練損失為:1.1653 訓(xùn)練精度為:0.6500
【EPOCH: 】61
訓(xùn)練損失為:0.8062 訓(xùn)練精度為:0.8071
【EPOCH: 】81
訓(xùn)練損失為:0.5322 訓(xùn)練精度為:0.9286
【EPOCH: 】101
訓(xùn)練損失為:0.3487 訓(xùn)練精度為:0.9714
【EPOCH: 】121
訓(xùn)練損失為:0.2132 訓(xùn)練精度為:0.9571
【EPOCH: 】141
訓(xùn)練損失為:0.1043 訓(xùn)練精度為:0.9929
【EPOCH: 】161
訓(xùn)練損失為:0.0601 訓(xùn)練精度為:1.0000
【EPOCH: 】181
訓(xùn)練損失為:0.0420 訓(xùn)練精度為:1.0000
【Finished Training!】>>>Train Accuracy: 1.0000 Train Loss: 0.0092
>>>Test Accuracy: 0.1800 Test Loss: 1.9587
訓(xùn)練集 | 測試集 | |
---|---|---|
Accuracy | 1.0000 | 0.1800 |
Loss | 0.0092 | 1.9587 |
完整代碼
import torch import torch.nn.functional as F import torch.nn as nn import torch_geometric.nn as pyg_nn from torch_geometric.datasets import Planetoid # 1.加載Cora數(shù)據(jù)集 dataset = Planetoid(root='./data/Cora', name='Cora') # 2.定義MLP網(wǎng)絡(luò) class MLP(nn.Module): def __init__(self, num_node_features, num_classes): super(MLP, self).__init__() self.lin_1 = pyg_nn.MLP([num_node_features, 32, 64, 128]) self.lin_2 = pyg_nn.MLP([128, 64, 32, num_classes]) def forward(self, data): x, edge_index = data.x, data.edge_index x = self.lin_1(x, edge_index) x = F.relu(x) x = F.dropout(x, training=self.training) x = self.lin_2(x, edge_index) return F.log_softmax(x, dim=1) device = torch.device('cuda' if torch.cuda.is_available() else 'cpu') # 設(shè)備 epochs = 200 # 學(xué)習(xí)輪數(shù) lr = 0.0003 # 學(xué)習(xí)率 num_node_features = dataset.num_node_features # 每個(gè)節(jié)點(diǎn)的特征數(shù) num_classes = dataset.num_classes # 每個(gè)節(jié)點(diǎn)的類別數(shù) data = dataset[0].to(device) # Cora的一張圖 # 3.定義模型 model = MLP(num_node_features, num_classes).to(device) optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=lr) # 優(yōu)化器 loss_function = nn.NLLLoss() # 損失函數(shù) # 訓(xùn)練模式 model.train() for epoch in range(epochs): optimizer.zero_grad() pred = model(data) loss = loss_function(pred[data.train_mask], data.y[data.train_mask]) # 損失 correct_count_train = pred.argmax(axis=1)[data.train_mask].eq(data.y[data.train_mask]).sum().item() # epoch正確分類數(shù)目 acc_train = correct_count_train / data.train_mask.sum().item() # epoch訓(xùn)練精度 loss.backward() optimizer.step() if epoch % 20 == 0: print("【EPOCH: 】%s" % str(epoch + 1)) print('訓(xùn)練損失為:{:.4f}'.format(loss.item()), '訓(xùn)練精度為:{:.4f}'.format(acc_train)) print('【Finished Training!】') # 模型驗(yàn)證 model.eval() pred = model(data) # 訓(xùn)練集(使用了掩碼) correct_count_train = pred.argmax(axis=1)[data.train_mask].eq(data.y[data.train_mask]).sum().item() acc_train = correct_count_train / data.train_mask.sum().item() loss_train = loss_function(pred[data.train_mask], data.y[data.train_mask]).item() # 測試集 correct_count_test = pred.argmax(axis=1)[data.test_mask].eq(data.y[data.test_mask]).sum().item() acc_test = correct_count_test / data.test_mask.sum().item() loss_test = loss_function(pred[data.test_mask], data.y[data.test_mask]).item() print('Train Accuracy: {:.4f}'.format(acc_train), 'Train Loss: {:.4f}'.format(loss_train)) print('Test Accuracy: {:.4f}'.format(acc_test), 'Test Loss: {:.4f}'.format(loss_test))
總結(jié)
到此這篇關(guān)于使用Pytorch+PyG實(shí)現(xiàn)MLP的文章就介紹到這了,更多相關(guān)Pytorch+PyG實(shí)現(xiàn)MLP內(nèi)容請(qǐng)搜索腳本之家以前的文章或繼續(xù)瀏覽下面的相關(guān)文章希望大家以后多多支持腳本之家!
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