快捷導(dǎo)航

R語言中igraph包的用法(鄰接矩陣)

更新時(shí)間：2021年04月19日 09:24:44 作者：today__present

這篇文章主要介紹了R語言中igraph包的用法(鄰接矩陣)，具有很好的參考價(jià)值，希望對大家有所幫助。一起跟隨小編過來看看吧

先導(dǎo)入igraph包：

library(igraph)

graph包最簡單的用法就是graph方法，兩句代碼就完成繪制如下所示，1的loop表示為（1，1），1和2之間有3條edge，表示為（1，2，1，2，1，2）

g <- graph(c(1,1,1,2,1,2,1,2,1,5,2,3,2,4,2,5,3,3,3,4,3,4,3,4,4,5),directed = FALSE)
plot(g)

如果用頂點(diǎn)的鄰接矩陣表示，仍以上圖為例：

則對1，1有l(wèi)oop，與2有條edge，與5有一條edge，所以鄰接矩陣的第一行為（1，3，0，0，1）；

類似地，可以得出鄰接矩陣的第2、3、4、5行；按列輸入上述矩陣：

cell <- c(1,3,0,0,1,3,0,1,1,1,0,1,1,3,0,0,1,3,0,1,1,1,0,1,0)                                     
cell <- matrix(cell,5,5,byrow=T)

使用graph.adjacency方法：

cnames <- c('a','b','c','d','e')                                         
g <- graph.adjacency(cell,mode="undirected")plot(g,vertex.label=cnames)#繪出圖像

補(bǔ)充：R語言學(xué)習(xí)-提取igraph的節(jié)點(diǎn)和邊

網(wǎng)絡(luò)分析的時(shí)候，可能需要提取出網(wǎng)絡(luò)中的節(jié)點(diǎn)或者邊，igraph包中其實(shí)提供了很多可用的函數(shù)。

#創(chuàng)建網(wǎng)絡(luò)方法之一：data.frame
data<-data.frame(id1=c(1,1,2,3,4,4,5,5,6,6,7,8,8,9,10,5,15,6,7,16),id2=c(2,11,11,12,13,14,15,16,7,15,16,17,18,18,9,19,19,19,19,19))
g <- graph_from_data_frame(data, directed=FALSE)    #directed 參數(shù)控制graph 有無方向
g
IGRAPH UN-- 16 17 -- 
+ attr: name (v/c)
+ edges (vertex names):
 [1] 1 --2  2 --3  3 --4  1 --4  5 --7  5 --6  5 --8  7 --6  7 --8  6 --8  9 --10 9 --13 11--10 11--12 12--13 14--15 1 --16
#圖形顯示
plot(g)

#V(g)和E(g)可以用來查看網(wǎng)絡(luò)g的節(jié)點(diǎn)和邊
 V(g)
+ 16/16 vertices, named:
 [1] 1  2  3  5  7  6  9  11 12 14 16 4  8  10 13 15
E(g)
+ 17/17 edges (vertex names):
 [1] 1 --2  2 --3  3 --4  1 --4  5 --7  5 --6  5 --8  7 --6  7 --8  6 --8  9 --10 9 --13 11--10 11--12 12--13 14--15 1 --16
#但問題是怎么將里面的數(shù)據(jù)提取出來放到變量里面呢？
#節(jié)點(diǎn)提取有個(gè)函數(shù)get.vertex.attribute(g)
get.vertex.attribute(g)
$name
 [1] "1"  "2"  "3"  "5"  "7"  "6"  "9"  "11" "12" "14" "16" "4"  "8"  "10" "13" "15"
#查看類型可知是list
class(get.vertex.attribute(g))
[1] "list"
#剩下的就簡單了
node<-get.vertex.attribute(g)[[1]]
node
 [1] "1"  "2"  "3"  "5"  "7"  "6"  "9"  "11" "12" "14" "16" "4"  "8"  "10" "13" "15"
#至于邊呢？可以使用get.edgelist()
get.edgelist(g)
      [,1] [,2]
 [1,] "1"  "2" 
 [2,] "2"  "3" 
 [3,] "3"  "4" 
 [4,] "1"  "4" 
 [5,] "5"  "7" 
 [6,] "5"  "6" 
 [7,] "5"  "8" 
 [8,] "7"  "6" 
 [9,] "7"  "8" 
[10,] "6"  "8" 
[11,] "9"  "10"
[12,] "9"  "13"
[13,] "11" "10"
[14,] "11" "12"
[15,] "12" "13"
[16,] "14" "15"
[17,] "1"  "16"
#類型是matrix矩陣可以直接使用
class(get.edgelist(g))
[1] "matrix"

以上為個(gè)人經(jīng)驗(yàn)，希望能給大家一個(gè)參考，也希望大家多多支持腳本之家。如有錯(cuò)誤或未考慮完全的地方，望不吝賜教。

您可能感興趣的文章: