R語言-實(shí)現(xiàn)list的嵌套與提取嵌套中的值
R的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)有很多種,常用的包括向量vector,矩陣matrix,數(shù)組array,列表list和dataframe數(shù)據(jù)框。
前三個都有其特定的性質(zhì)和結(jié)構(gòu)
今天要介紹的是list,它非常靈活好用~因?yàn)榭梢源娣挪煌瑪?shù)據(jù)類型
之前做assignment的時候還沒有發(fā)現(xiàn)list的美妙,但現(xiàn)在寫畢業(yè)論文數(shù)據(jù)量開始變大,同時通過調(diào)用Rpackage常常產(chǎn)生各種數(shù)據(jù)類型,漸漸發(fā)覺list真的很好用!
因?yàn)槭褂昧薴or循環(huán),還會產(chǎn)生層層嵌套的超大list,這時候,如何定義這個嵌套的list,如何取出里面的值就變得很重要。
具體的邏輯關(guān)系其實(shí)很簡單,只要頭腦清醒不把自己繞暈,無論多少層輕松搞定!
先拿兩層的為例好了:
題目:
從同一個函數(shù)隨機(jī)生成20個data sets,每個data set都用K-means進(jìn)行分類,K從2~10都遍歷一遍。結(jié)果保存在一個list里。
第一步:
生成data set的函數(shù)已經(jīng)給出了。20個數(shù)據(jù)就是run20次~因?yàn)槭请S機(jī)生成的,最后得到的每個data set都不相同。然后把這20個數(shù)據(jù)集都存在一個list里~
art2 <- function(){
x1 <- rnorm(20)
y1 <- rnorm(20)
x2 <- rnorm(20,mean=10)
y2 <- rnorm(20)
x3 <- runif(100,-20,30)
y3 <- runif(100,20,40)
clusterdata2 <- cbind(c(x1,x2,x3),c(y1,y2,y3))
cvec <- c(rep(1,20),rep(2,20),rep(3,100))
out <- list(data=clusterdata2,cvec=cvec)
out
}
datasets<-list()
for (i in 1:20){
datasets[[i]]<- art2()
}
為什么我的datasets要包兩層,是[[i]]? 其實(shí)這里就有l(wèi)ist的嵌套了。看我在生成的函數(shù)里已經(jīng)有一個list,里面包含兩個元素,一個是$data:生成的原始數(shù)據(jù);另一個是$cvec:原始數(shù)據(jù)對應(yīng)的實(shí)際分類。所以我想要個大的list把這20個list都包含在內(nèi),就得來個嵌套~兩個框框——[[i]]就是兩層?。ㄎ覄倓偼蝗幌氲絒[[i]]]會不會是三層啊?。。我沒試過也,因?yàn)槊總€循環(huán)都是新增一層list,不會直接增兩層,不然有層為空就會報(bào)錯,哎呦我表述好難,先繼續(xù)往下吧~~
p.s. 如果想要提取第5次生成的結(jié)果,就datasets[[5]],當(dāng)然這里面還包含兩個元素:原始數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)和實(shí)際分類。如果想提取里面的原始數(shù)據(jù)數(shù)據(jù),就datasets[[5]]$data,想提取里面的實(shí)際分類,則是datasets[[5]]$cvec。想提取全部20次的結(jié)果:直接datasets。如果!想要提取20次結(jié)果里的原始數(shù)據(jù),就沒那么直接了。得用for循環(huán)從1~20來一個datasets[[i]]$dat逐一取出來。這個應(yīng)該很好理解,因?yàn)樾ist里是包含兩種元素,外面嵌套list的才是重復(fù)20次。
第二步:
然后就是對這個大的datasets運(yùn)行K-means,K=2~10。這里有兩個循環(huán),一個是我首先要把datasets從1~20走一遍,然后里面每個data set我都要從K=2~10計(jì)算K-means的結(jié)果。for循環(huán)很好寫,具體的框架大致就是這樣:”???“ 的地方是需要思考滴
for (k in 2:10){
for (i in 1:20){
???<- kmeans(datasets[[i]]$data,k,nstart=50)
???
}
}
K-means的語句里同時包含了i和k,所以這個結(jié)果會是一個嵌套的list。照我這樣寫for循環(huán),里面那層就是i=1~20,外面那層是k=2~10。所以是當(dāng)k=2時,把20個data sets循環(huán)一遍,然后k=3,再循環(huán)……直到k=10。所以我們要先保存固定k時的i=1~20的run出來的結(jié)果,第一個"???" 就得包括i,并且跟k無關(guān)。而且因?yàn)閗means的結(jié)果返回的個list,里面包含了各種元素:$cluster, $size,等等。所以這跟上面datasets的保存一樣,得是[[i]],兩層!
第一個"???"已經(jīng)解決了,假設(shè)是ks[[i]], 保存了當(dāng)k固定時循環(huán)i=1~20的結(jié)果。現(xiàn)在我們要循環(huán)k=2~10,等于在列表ks的外面再嵌套一個list,是關(guān)于k循環(huán)的,跟i已經(jīng)沒什么關(guān)系了。所以下一個"???" 就得是kmean[[k]]<-ks。
結(jié)果就是這樣的~
kmean <- list()
ks <- list()
for (k in 2:10){
for (i in 1:20){
ks[[i]] <- kmeans(datasets[[i]]$data,k,nstart=50)
kmean[[k]]<-ks
}
}
現(xiàn)在講講怎么提取里面的數(shù)值。kmean是一個三層的list。最外面那層是跟k有關(guān)的,中間那層是跟i有關(guān),里面那層是K-means的output作為一個list。
所以kmean[[k]], k=2~10, 是當(dāng)k=k時20次K-means的結(jié)果。
如果想取k=2,第5個data sets的K-means結(jié)果,就是kmean[[2]][[5]],如果想取k=4,第1個data sets的K-means得到的分類結(jié)果cluster:kmean[[4]][[1]]$cluster。
Done!這是我個人在實(shí)際操作過程中的一個總結(jié),所以如果有什么問題歡迎一起來討論~
Further studying——
在factorial experiment design里我們經(jīng)常會考慮多個factors因子,每個因子考慮幾個levels。算了我直接拿我的例子來講好了。。。在我最近做的事情里,要生成像開頭一樣的分類數(shù)據(jù)generate random clusters。
因?yàn)槭且蜃訉?shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),所以我考慮了三個因子:(1) the number of clusters 每個data中有幾個群組,像開頭的例子就有3個,這里我定的level是2,3,5; (2) the number of points in each cluster每群組里有多少點(diǎn) ,定的level是25,100,225; and (3) the degree of separation群組和群組之間相隔的遠(yuǎn)還是近,函數(shù)里面有個sepVal可以定義,我定的是0.01和0.021; 最后是重復(fù)2遍。把所有結(jié)果存到一個list里
感覺講得不太清楚T T。??创a吧!我想表達(dá)的意思就是無論考慮多少個因子,list會新增多少層,只要按照上面的方法一層層疊加就好了!重點(diǎn)是搞清楚每次層代表的含義,還有明白怎么樣取出想要的值~
cluster<-c(2,3,5)
point<-c(25,100,225)
sepval<-c(0.01,0.21)
repl<-2
#Eq=1:the number of points in each cluster is the same.
t<-list()
gen<-list()
Eq1<-list()
for (i in 1:3){
for (j in 1:3){
for (k in 1:2){
t[[k]] <- genRandomClust(numClust=cluster[i], sepVal=sepval[k], numNonNoisy=2,
numNoisy=0, numOutlier=0, numReplicate=repl, fileName="Eq1",
clustszind=1,
clustSizeEq=point[j],
outputDatFlag=F,
outputLogFlag=F,
outputEmpirical=F,
outputInfo=F)
gen[[j]]<-t
Eq1[[i]]<-gen
}
}
}
#Eq1[[i]][[j]][[k]]
#Eq1[[i]][[j]][[k]]$datList[[1]]:rep1
#Eq1[[i]][[j]][[k]]$datList[[2]]:rep2
補(bǔ)充:如何從嵌套很多層的列表中直接取出所有數(shù)值
給定列表
s = [[[[[[1, 1]], [[9, 1]]], [[5, 1]]], [[[3, 1]], [[7, 1]]]], [[[[2, 1]], [[6, 1]]], [[[4, 1]], [[8, 1]]]]] s[0] 是 [[[[[1, 1]], [[9, 1]]], [[5, 1]]], [[[3, 1]], [[7, 1]]]] s[1] 是 [[[[2, 1]], [[6, 1]]], [[[4, 1]], [[8, 1]]]]
每一個外層列表都包含2個子列表不停往下嵌套,并且s[0] 比s[1] 多嵌套一層
解決方案
方法1
轉(zhuǎn)字符串之后使用replace替換掉不需要的值,例如
b = str(s).replace('[', '').replace(']', '').replace(' ', '').split(',')
for m,n in enumerate(b):
if m%2 == 0:
result.append(int(n))
這里根據(jù)需求刪掉了每一個最里層列表的第二維的值
方法2
優(yōu)美一點(diǎn)的解法是用遞歸去取值
def flat(nums):
res = []
for i in nums:
if isinstance(i, list):
res.extend(flat(i))
else:
res.append(i)
return res
result = flat(s)
結(jié)果:
[1, 1, 9, 1, 5, 1, 3, 1, 7, 1, 2, 1, 6, 1, 4, 1, 8, 1]
去掉多余的1之后和下面的結(jié)果一致
結(jié)果:
result
Out[157]: [1, 9, 5, 3, 7, 2, 6, 4, 8]
tips
這個序列來源是一道算法題,要求是找到一個1到n正整數(shù)序列,使得任意一個中間的數(shù)乘以二不能等于兩邊各自任取一個數(shù)之和(即 aj * 2 != ai + ak, 其中 i<j<k ,i,j,k之間的差值不定),有興趣的小伙伴可以做一下,希望能給大家一個參考,也希望大家多多支持腳本之家。如有錯誤或未考慮完全的地方,望不吝賜教。
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