python 提取文件指定列的方法示例
更新時間：2019年08月07日 09:29:16 作者：baker00
這篇文章主要介紹了python 提取文件指定列的方法示例，文中通過示例代碼介紹的非常詳細，對大家的學習或者工作具有一定的參考學習價值，需要的朋友們下面隨著小編來一起學習學習吧
之前用featureCount 處理得到結(jié)果，要提出第一列g(shù)ene_id 和 readcount 列，首先軟件輸出的第一行默認是你使用的命令行，沒有用，用bash批量刪掉。
for i in `ls`;do sed -i '1d' $i;done
刪除當前文件夾下所有文件第一行。
其實提出兩列很簡單，不過我受夠了每次一個文件執(zhí)行一次的煩。想搞成別的程序調(diào)用時命令行參數(shù)直接就行。第一次知道sys.argv這玩意，學到了。
我設置了 -i 輸入，-o 輸出 這兩個參數(shù)來判斷輸入輸出文件個數(shù)，不過對于錯誤命令行輸入的判斷還很欠缺，畢竟只有自己用。
上代碼：
import sys
leng=len(sys.argv)
for i in range(leng): # index the input file and output file location,maybe it's too complex
if sys.argv[i]=="-i":
it=i
if sys.argv[i]=="-o":
out=i
for i in range(it+1,out): # input file number(there should have same # of in and out file)
print(sys.argv[i])
file=open(sys.argv[i],'r')
f=open(sys.argv[i+out-it],'w')
count=[]
for lines in file.readlines():
two=[]
lines=lines.rstrip('\n')
b=lines.split('\t')
two.append(b[0])
if(b[6].startswith('.')): #chage path to count,some output problem
b[6]="count"
two.append(b[6])
s='\t'.join(two)
f.write(s+'\n')
f.close
其實python里面 str 和list 弄的還是昏頭昏腦的，每次都要錯了再改。
以上就是本文的全部內(nèi)容，希望對大家的學習有所幫助，也希望大家多多支持腳本之家。
相關(guān)文章
本文分享了Linux系統(tǒng)下Python連接Redis的基本配置方法，Python連接Redis需要Redis的Python包支持2018-09-09
利用django-suit模板添加自定義的菜單、頁面及設置訪問權(quán)限
這篇文章主要給大家介紹了關(guān)于利用django-suit模板添加自定義的菜單、頁面及設置訪問權(quán)限的相關(guān)資料,文中通過示例代碼介紹的非常詳細，對大家的學習或者工作具有一定的參考學習價值，需要的朋友們下面隨著小編來一起看看吧2018-07-07
這篇文章主要介紹了在IIS服務器上以CGI方式運行Python腳本的教程,雖然IIS的性能并不理想...需要的朋友可以參考下2015-04-04
在本文里我們給大家分析那個了關(guān)于python三引號輸出方法以及相關(guān)知識點，需要的朋友們學習下。2019-02-02
pytest官方文檔解讀fixtures的調(diào)用方式
這篇文章主要為大家介紹了pytest官方文檔解讀fixtures的調(diào)用方式，有需要的朋友可以借鑒參考下，希望能夠有所幫助，祝大家多多進步，早日升職加薪2022-06-06
python讀取json數(shù)據(jù)還原表格批量轉(zhuǎn)換成html
這篇文章主要介紹了python讀取json數(shù)據(jù)還原表格批量轉(zhuǎn)換成html，由于需要對ocr識別系統(tǒng)的表格識別結(jié)果做驗證，通過返回的json文件結(jié)果對比比較麻煩，故需要將json文件里面的識別結(jié)果還原為表格做驗證，下面詳細內(nèi)容需要的小伙伴可以參考一下2022-03-03
這篇文章主要給大家介紹了關(guān)于python自動化之如何利用allure生成測試報告的相關(guān)資料，文中通過示例代碼介紹的非常詳細，對大家的學習或者工作具有一定的參考學習價值，需要的朋友們下面隨著小編來一起學習學習吧2021-05-05
本文給大家講述的是python 默認參數(shù)問題的陷阱，有需要的小伙伴可以參考下2016-02-02
Python+ChatGPT實現(xiàn)5分鐘快速上手編程
最近一段時間chatGPT火爆出圈！無論是在互聯(lián)網(wǎng)行業(yè)，還是其他各行業(yè)都賺足了話題。俗話說：“外行看笑話，內(nèi)行看門道”，今天從chatGPT個人體驗感受以及如何用的角度來分享一下2023-02-02
這篇文章主要介紹了python jieba庫的基本使用，幫助大家更好的理解和學習使用python，感興趣的朋友可以了解下2021-03-03